NCBI Logo
GEO Logo
   NCBI > GEO > Accession DisplayHelp Not logged in | LoginHelp
GEO help: Mouse over screen elements for information.
          Go
Platform GPL10655 Query DataSets for GPL10655
Status Public on Dec 31, 2011
Title [MoGene-1_0-st] Affymetrix Mouse Gene 1.0 ST Array [v1.na30.1.mm9.probeset]
Technology type in situ oligonucleotide
Distribution custom-commercial
Organism Mus musculus
Manufacturer Affymetrix
Manufacture protocol See manufacturer's web site
 
Description Affymetrix submissions are typically submitted to GEO using the GEOarchive method described at http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/geo/info/geo_affy.html

#%create_date=Tue Dec 8 17:31:33 2009 PST
#%chip_type=MoGene-1_0-st-v1
#%lib_set_name=MoGene-1_0-st
#%lib_set_version=v1
#%genome-species=Mus musculus
#%genome-version=mm9
#%genome-version-ucsc=mm9
#%genome-version-ncbi=37
#%genome-version-create_date=2007-07
#%netaffx-annotation-date=2009-11-16
#%netaffx-annotation-netaffx-build=30.1
#%netaffx-annotation-tabular-data-version=1.2
#%netaffx-annotation-tabular-format-version=1.1
#%netaffx-annotation-data-type=probe_set
#%netaffx-annotation-docgen-method=module:affy/annotation_update/builder; exec:create-download-file.pl
#%netaffx-annotation-docgen-version=1.12
 
Web link http://www.affymetrix.com/support/technical/byproduct.affx?product=mogene-1_0-st-v1
http://www.affymetrix.com/support/technical/libraryfilesmain.affx
Submission date Jul 08, 2010
Last update date Dec 31, 2011
Contact name Kate S Collison
Organization name King Faisal Specialist Hospital & Research Centre
Street address Department Biological & Medical Research
City Riyadh
ZIP/Postal code POB3354
Country Saudi Arabia
 
Samples (16) GSM565225, GSM565226, GSM565227, GSM565228, GSM565229, GSM565230 
Series (1)
GSE22881 Expression data from murine cardiac tissue
Relations
Alternative to GPL6246

Data table header descriptions
ID probeset_id
seqname
RANGE_GB
SPOT_ID
RANGE_STRAND
RANGE_START
RANGE_END
GB_LIST
probe_count
transcript_cluster_id
exon_id
psr_id
gene_assignment
mrna_assignment
crosshyb_type
number_independent_probes
number_cross_hyb_probes
number_nonoverlapping_probes
level
bounded
noBoundedEvidence
has_cds
fl
mrna
est
vegaGene
vegaPseudoGene
ensGene
sgpGene
exoniphy
twinscan
geneid
genscan
genscanSubopt
human_fl
human_mrna
rat_fl
rat_mrna
microRNAregistry
rnaGene
mitomap
probeset_type

Data table
ID seqname RANGE_GB SPOT_ID RANGE_STRAND RANGE_START RANGE_END GB_LIST probe_count transcript_cluster_id exon_id psr_id gene_assignment mrna_assignment crosshyb_type number_independent_probes number_cross_hyb_probes number_nonoverlapping_probes level bounded noBoundedEvidence has_cds fl mrna est vegaGene vegaPseudoGene ensGene sgpGene exoniphy twinscan geneid genscan genscanSubopt human_fl human_mrna rat_fl rat_mrna microRNAregistry rnaGene mitomap probeset_type
10344615 chr1 NC_000067.5 + 3044331 3044814 33 10344614 85309329 84558239 --- GENSCAN00000037374 // chr1 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000022507 // chr1 // 54 // 13 // 24 // 0 /// ENSMUST00000120023 // chr1 // 21 // 6 // 29 // 1 /// XR_034671 // chr1 // 3 // 1 // 31 // 1 /// XR_030628 // chr1 // 21 // 7 // 33 // 1 /// XR_030763 // chr1 // 18 // 6 // 33 // 1 /// GENSCAN00000005494 // chr1 // 12 // 4 // 33 // 1 /// GENSCAN00000048638 // chr1 // 33 // 4 // 12 // 1 3 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 main
10344617 chr1 NC_000067.5 + 3092102 3092199 25 10344616 85309331 84558242 --- ENSMUST00000082908 // chr1 // 100 // 25 // 25 // 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 main
10344621 chr1 NC_000067.5 + 3670653 3670980 25 10344620 85309335 84558248 ENSMUST00000097833 // Gm10568 ENSMUST00000097833 // chr1 // 100 // 25 // 25 // 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 main
10344623 chr1 NC_000067.5 + 4761241 4762150 NM_024221 8 10344622 85309339 84558254 NM_024221 // Pdhb /// ENSMUST00000022268 // Pdhb /// BC094468 // Pdhb /// XR_030609 // Gm6123 XR_030609 // chr1 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000047522 // chr1 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NM_024221 // chr1 // 33 // 2 // 6 // 1 /// ENSMUST00000022268 // chr1 // 33 // 2 // 6 // 1 /// BC094468 // chr1 // 33 // 2 // 6 // 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 main
10344625 chr1 NC_000067.5 + 4798010 4798046 NM_008866 3 10344624 85309341 84558259 NM_008866 // Lypla1 /// ENSMUST00000027036 // Lypla1 /// CT010201 // Lypla1 /// BC013536 // Lypla1 /// BC052848 // Lypla1 /// U89352 // Lypla1 /// ENSMUST00000119612 // Lypla1 /// ENSMUST00000115529 // Lypla1 /// AK050549 // Lypla1 /// AK167231 // Lypla1 NM_008866 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENSMUST00000027036 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// CT010201 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// BC013536 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// BC052848 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// U89352 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENSMUST00000119612 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENSMUST00000115529 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// AK050549 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// AK167231 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 1 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 main
10344626 chr1 NC_000067.5 + 4798541 4798567 NM_008866 3 10344624 85309342 84558261 NM_008866 // Lypla1 /// ENSMUST00000027036 // Lypla1 /// CT010201 // Lypla1 /// BC013536 // Lypla1 /// BC052848 // Lypla1 /// U89352 // Lypla1 /// ENSMUST00000119612 // Lypla1 /// ENSMUST00000115529 // Lypla1 /// AK050549 // Lypla1 /// AK167231 // Lypla1 NM_008866 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENSMUST00000027036 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// CT010201 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// BC013536 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// BC052848 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// U89352 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENSMUST00000119612 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENSMUST00000115529 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// AK050549 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// AK167231 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 1 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 main
10344627 chr1 NC_000067.5 + 4818689 4818727 NM_008866 3 10344624 85309343 84558263 NM_008866 // Lypla1 /// ENSMUST00000027036 // Lypla1 /// CT010201 // Lypla1 /// BC013536 // Lypla1 /// BC052848 // Lypla1 /// U89352 // Lypla1 /// ENSMUST00000119612 // Lypla1 /// ENSMUST00000115529 // Lypla1 /// AK050549 // Lypla1 /// AK167231 // Lypla1 NM_008866 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENSMUST00000027036 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// CT010201 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// BC013536 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// BC052848 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// U89352 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENSMUST00000119612 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENSMUST00000115529 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// AK050549 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// AK167231 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 1 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 main
10344628 chr1 NC_000067.5 + 4822393 4822422 NM_008866 3 10344624 85309345 84558267 NM_008866 // Lypla1 /// ENSMUST00000027036 // Lypla1 /// CT010201 // Lypla1 /// BC013536 // Lypla1 /// BC052848 // Lypla1 /// U89352 // Lypla1 /// ENSMUST00000119612 // Lypla1 /// ENSMUST00000115529 // Lypla1 /// AK050549 // Lypla1 /// AK167231 // Lypla1 NM_008866 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENSMUST00000027036 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// CT010201 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// BC013536 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// BC052848 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// U89352 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENSMUST00000119612 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENSMUST00000115529 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// AK050549 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// AK167231 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// GENSCAN00000047523 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 1 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 main
10344629 chr1 NC_000067.5 + 4827107 4827144 NM_008866 3 10344624 85309346 84558269 NM_008866 // Lypla1 /// ENSMUST00000027036 // Lypla1 /// CT010201 // Lypla1 /// BC013536 // Lypla1 /// BC052848 // Lypla1 /// U89352 // Lypla1 /// ENSMUST00000119612 // Lypla1 /// ENSMUST00000115529 // Lypla1 /// AK050549 // Lypla1 /// AK034851 // Lypla1 /// AK167231 // Lypla1 NM_008866 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENSMUST00000027036 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// CT010201 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// BC013536 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// BC052848 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// U89352 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENSMUST00000119612 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENSMUST00000115529 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// AK050549 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// AK034851 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// AK167231 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// GENSCAN00000047523 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 1 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 main
10344630 chr1 NC_000067.5 + 4829468 4829569 NM_008866 3 10344624 85309347 84558271 NM_008866 // Lypla1 /// ENSMUST00000027036 // Lypla1 /// CT010201 // Lypla1 /// BC013536 // Lypla1 /// BC052848 // Lypla1 /// U89352 // Lypla1 /// AK050549 // Lypla1 /// AK034851 // Lypla1 /// AK167231 // Lypla1 NM_008866 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENSMUST00000027036 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// CT010201 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// BC013536 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// BC052848 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// U89352 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// AK050549 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// AK034851 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// AK167231 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 1 0 0 1 0 0 0 5 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 main
10344631 chr1 NC_000067.5 + 4831038 4831080 NM_008866 2 10344624 85309348 84558273 NM_008866 // Lypla1 /// ENSMUST00000027036 // Lypla1 /// CT010201 // Lypla1 /// BC013536 // Lypla1 /// U89352 // Lypla1 /// BC052848 // Lypla1 /// ENSMUST00000119612 // Lypla1 /// ENSMUST00000115529 // Lypla1 /// AK050549 // Lypla1 /// AK034851 // Lypla1 NM_008866 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// ENSMUST00000027036 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// CT010201 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// BC013536 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// U89352 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// BC052848 // chr1 // 50 // 1 // 2 // 0 /// ENSMUST00000119612 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// ENSMUST00000115529 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// AK050549 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// AK034851 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// GENSCAN00000047523 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 1 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 main
10344632 chr1 NC_000067.5 + 4835650 4835871 NM_008866 3 10344624 85309349 84558277 NM_008866 // Lypla1 /// ENSMUST00000027036 // Lypla1 /// BC013536 // Lypla1 /// BC052848 // Lypla1 /// AK167231 // Lypla1 NM_008866 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENSMUST00000027036 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// BC013536 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// BC052848 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// AK167231 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 1 0 0 3 0 0 0 3 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 main
10344634 chr1 NC_000067.5 + 4847951 4847977 NM_011541, NM_001159750 3 10344633 85309351 84558284 NM_011541 // Tcea1 /// NM_001159750 // Tcea1 /// ENSMUST00000081551 // Tcea1 /// BC083127 // Tcea1 NM_011541 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// NM_001159750 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENSMUST00000081551 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// BC083127 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 1 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 main
10344635 chr1 NC_000067.5 + 4868118 4868157 NM_001159751, NM_011541, NM_001159750 3 10344633 85309353 84558288 NM_001159751 // Tcea1 /// NM_011541 // Tcea1 /// NM_001159750 // Tcea1 /// ENSMUST00000081551 // Tcea1 /// BC083127 // Tcea1 NM_001159751 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// NM_011541 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// NM_001159750 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENSMUST00000081551 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// BC083127 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 1 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 main
10344636 chr1 NC_000067.5 + 4882097 4882137 NM_001159751, NM_011541, NM_001159750 2 10344633 85309357 84558297 NM_001159751 // Tcea1 /// NM_011541 // Tcea1 /// NM_001159750 // Tcea1 /// ENSMUST00000081551 // Tcea1 /// BC083127 // Tcea1 NM_001159751 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// NM_011541 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// NM_001159750 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// ENSMUST00000081551 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// BC083127 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 1 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 main
10344638 chr1 NC_000067.5 + 5073272 5073313 NM_133826 2 10344637 85309362 84558310 NM_133826 // Atp6v1h /// ENSMUST00000044369 // Atp6v1h /// BC009154 // Atp6v1h NM_133826 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// ENSMUST00000044369 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// BC009154 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 1 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 main
10344639 chr1 NC_000067.5 + 5074567 5074623 NM_133826 2 10344637 85309363 84558312 NM_133826 // Atp6v1h /// ENSMUST00000044369 // Atp6v1h /// BC009154 // Atp6v1h NM_133826 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// ENSMUST00000044369 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// BC009154 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 1 0 0 2 0 0 0 2 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 main
10344640 chr1 NC_000067.5 + 5079140 5079172 NM_133826 2 10344637 85309364 84558314 NM_133826 // Atp6v1h /// ENSMUST00000044369 // Atp6v1h /// BC009154 // Atp6v1h NM_133826 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// ENSMUST00000044369 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// BC009154 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 1 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 main
10344641 chr1 NC_000067.5 + 5083465 5083519 NM_133826 2 10344637 85309365 84558316 NM_133826 // Atp6v1h /// ENSMUST00000044369 // Atp6v1h /// BC009154 // Atp6v1h NM_133826 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// ENSMUST00000044369 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// BC009154 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 1 0 0 2 0 0 0 2 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 main
10344642 chr1 NC_000067.5 + 5085700 5085807 NM_133826 2 10344637 85309366 84558318 NM_133826 // Atp6v1h /// ENSMUST00000044369 // Atp6v1h /// BC009154 // Atp6v1h NM_133826 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// ENSMUST00000044369 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// BC009154 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 1 0 0 2 0 0 0 2 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 main

Total number of rows: 241293

Table truncated, full table size 102800 Kbytes.




Download family Format
SOFT formatted family file(s) SOFTHelp
MINiML formatted family file(s) MINiMLHelp

Supplementary data files not provided
| NLM | NIH | GEO Help | Disclaimer | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap