NCBI Logo
GEO Logo
   NCBI > GEO > Accession DisplayHelp Not logged in | LoginHelp
GEO help: Mouse over screen elements for information.
          Go
Platform GPL19230 Query DataSets for GPL19230
Status Public on Sep 25, 2014
Title [EleGene-1_0-st] Affymetrix C. elegans Gene 1.0 ST Array [transcript (gene) version]
Technology type in situ oligonucleotide
Distribution commercial
Organism Caenorhabditis elegans
Manufacturer Affymetrix
Manufacture protocol See manufacturer's web site
 
Description Affymetrix submissions are typically submitted to GEO using the GEOarchive method described at http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/geo/info/geo_affy.html

#EleGene-1_0-st-v1.na34.ce6.transcript.csv
#%create_date=Tue May 6 17:48:56 2014 PDT
#%chip_type=EleGene-1_0-st-v1
#%lib_set_name=EleGene-1_0-st
#%lib_set_version=v1
#%genome-species=Caenorhabditis elegans
#%genome-version=ce6
#%genome-version-ucsc=ce6
#%genome-version-create_date=2008-05-00
#%genome-lifted-method=NONE
#%genome-lifted_from-species=Caenorhabditis elegans
#%genome-lifted_from-version-ucsc=ce6
#%netaffx-annotation-date=2013-08-30
#%netaffx-annotation-netaffx-build=34
 
Submission date Sep 25, 2014
Last update date Nov 08, 2017
Organization Affymetrix, Inc.
E-mail(s) [email protected], [email protected]
Phone 888-362-2447
URL http://www.affymetrix.com/index.affx
Street address
City Santa Clara
State/province CA
ZIP/Postal code 95051
Country USA
 
Samples (315) GSM1513691, GSM1513692, GSM1513693, GSM1513694, GSM1513695, GSM1513696 
Series (27)
GSE61771 Expression data of isp-1(qm150);ctb-1(qm189) mutant, exposed to klf-1 RNAi during development or adulthood
GSE70692 Comparison of gene expression in sams-1(RNAi) and sbp-1(RNAi) adult C. elegans
GSE93186 Transcriptomic fingerprints of C. elegans exposed to superparamagnetic iron oxide nanoparticles coated with a monolayer of bovine serum albumin (BSA-SPIONs)

Data table header descriptions
ID transcript cluster id
probeset_id
seqname
strand
start
stop
total_probes
gene_assignment
mrna_assignment
swissprot
unigene
crosshyb_type
category
SPOT_ID

Data table
ID probeset_id seqname strand start stop total_probes gene_assignment mrna_assignment swissprot unigene crosshyb_type category SPOT_ID
18450782 18450782 chrI + 12773647 12782247 27 B0019.2.2 // CELE_B0019.2 // Protein B0019.2 // --- // 173147 /// B0019.2.1 // CELE_B0019.2 // Protein B0019.2 // --- // 173147 /// NM_060836 // CELE_B0019.2 // Protein B0019.2 // --- // 173147 B0019.2.2 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:12773657:12782257:1 gene:B0019.2 transcript:B0019.2.2 description:Protein B0019.2 // chrI // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// B0019.2.1 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:12773659:12782257:1 gene:B0019.2 transcript:B0019.2.1 description:Protein B0019.2 // chrI // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_060836 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein B0019.2 (B0019.2) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 B0019.2.2 // G5EBL4 /// B0019.2.1 // G5EBL4 /// NM_060836 // G5EBL4 B0019.2.2 // Cel.19323 // --- /// B0019.2.1 // Cel.19323 // --- /// NM_060836 // Cel.19323 // --- 1 main chrI(+):12773647-12782247
18450797 18450797 chrI + 6028488 6033460 29 B0025.1a // vps-34 // Protein VPS-34 // --- // 172280 /// B0025.1c.1 // vps-34 // Protein VPS-34 // --- // 172280 /// B0025.1c.2 // vps-34 // Protein VPS-34 // --- // 172280 /// B0025.1b // vps-34 // Protein VPS-34 // --- // 172280 /// NM_059340 // vps-34 // Protein VPS-34 // --- // 172280 /// NM_001025783 // vps-34 // Protein VPS-34 // --- // 172280 /// NM_001025782 // vps-34 // Protein VPS-34 // --- // 172280 B0025.1a // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:6028486:6033458:1 gene:B0025.1 transcript:B0025.1a description:Protein VPS-34, isoform a // chrI // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// B0025.1c.1 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:6028486:6033458:1 gene:B0025.1 transcript:B0025.1c.1 description:Protein VPS-34, isoform a // chrI // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// B0025.1c.2 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:6028498:6033458:1 gene:B0025.1 transcript:B0025.1c.2 description:Protein VPS-34, isoform a // chrI // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// B0025.1b // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:6029772:6033458:1 gene:B0025.1 transcript:B0025.1b description:Protein VPS-34, isoform a // chrI // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NM_059340 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein VPS-34, isoform a (vps-34) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NM_001025783 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein VPS-34, isoform c (vps-34) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NM_001025782 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein VPS-34, isoform b (vps-34) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 B0025.1a // Q5TYK9 /// B0025.1a // Q9TXI6 /// B0025.1a // Q9TXI7 /// B0025.1a // Q9XZR0 /// B0025.1c.1 // Q5TYK9 /// B0025.1c.1 // Q9TXI6 /// B0025.1c.1 // Q9XZR0 /// B0025.1c.2 // Q5TYK9 /// B0025.1c.2 // Q9TXI6 /// B0025.1c.2 // Q9XZR0 /// B0025.1b // Q9TXI6 /// B0025.1b // Q9XZR0 /// NM_059340 // Q9XZR0 /// NM_059340 // Q9TXI7 /// NM_001025783 // Q9XZR0 /// NM_001025783 // Q5TYK9 /// NM_001025782 // Q9XZR0 /// NM_001025782 // Q9TXI6 B0025.1a // Cel.6170 // embryo| L1 larva /// B0025.1c.1 // Cel.6170 // embryo| L1 larva /// B0025.1c.2 // Cel.6170 // embryo| L1 larva /// B0025.1b // Cel.6170 // embryo| L1 larva /// NM_059340 // Cel.6170 // embryo| L1 larva /// NM_001025783 // Cel.6170 // embryo| L1 larva /// NM_001025782 // Cel.6170 // embryo| L1 larva 1 main chrI(+):6028488-6033460
18450806 18450806 chrI + 6022659 6026983 24 B0025.2.3 // csn-2 // Protein CSN-2 // --- // 172278 /// B0025.2.2 // csn-2 // Protein CSN-2 // --- // 172278 /// B0025.2.1 // csn-2 // Protein CSN-2 // --- // 172278 /// NM_059339 // csn-2 // Protein CSN-2 // --- // 172278 B0025.2.3 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:6022657:6026981:1 gene:B0025.2 transcript:B0025.2.3 description:COP9 signalosome complex subunit 2 // chrI // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// B0025.2.2 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:6022660:6026981:1 gene:B0025.2 transcript:B0025.2.2 description:COP9 signalosome complex subunit 2 // chrI // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// B0025.2.1 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:6022667:6026981:1 gene:B0025.2 transcript:B0025.2.1 description:COP9 signalosome complex subunit 2 // chrI // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_059339 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein CSN-2 (csn-2) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 NM_059339 // O01422 B0025.2.3 // Cel.7990 // L1 larva| L4 larva /// B0025.2.2 // Cel.7990 // L1 larva| L4 larva /// B0025.2.1 // Cel.7990 // L1 larva| L4 larva /// NM_059339 // Cel.7990 // L1 larva| L4 larva 1 main chrI(+):6022659-6026983
18450814 18450814 chrI + 6027194 6028372 25 B0025.4.2 // B0025.4 // Protein B0025.4 // --- // 172279 /// B0025.4.1 // B0025.4 // Protein B0025.4 // --- // 172279 /// NM_170871 // B0025.4 // Protein B0025.4 // --- // 172279 B0025.4.2 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:6027192:6028370:1 gene:B0025.4 transcript:B0025.4.2 description:Protein B0025.4 // chrI // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// B0025.4.1 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:6027194:6028370:1 gene:B0025.4 transcript:B0025.4.1 description:Protein B0025.4 // chrI // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_170871 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein B0025.4 (B0025.4) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 B0025.4.2 // Q8WQC3 /// B0025.4.1 // Q8WQC3 /// NM_170871 // Q8WQC3 B0025.4.2 // Cel.23228 // embryo /// B0025.4.1 // Cel.23228 // embryo /// NM_170871 // Cel.23228 // embryo 1 main chrI(+):6027194-6028372
18450818 18450818 chrI + 4664500 4665349 28 B0041.1 // B0041.1 // Protein B0041.1 // --- // 181822 /// NM_059021 // B0041.1 // Protein B0041.1 // --- // 181822 B0041.1 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:4664499:4665348:1 gene:B0041.1 transcript:B0041.1 description:Protein B0041.1 // chrI // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_059021 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein B0041.1 (B0041.1) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 B0041.1 // O02060 /// NM_059021 // O02060 B0041.1 // Cel.34608 // --- /// NM_059021 // Cel.34608 // --- 1 main chrI(+):4664500-4665349
18450827 18450827 chrI + 4653472 4659519 31 B0041.2a.2 // ain-2 // Protein AIN-2 // --- // 172076 /// B0041.2c.2 // ain-2 // Protein AIN-2 // --- // 172076 /// B0041.2d // ain-2 // Protein AIN-2 // --- // 172076 /// B0041.2b // ain-2 // Protein AIN-2 // --- // 172076 /// NM_001262753 // ain-2 // Protein AIN-2 // --- // 172076 /// B0041.2a.1 // ain-2 // Protein AIN-2 // --- // 172076 /// B0041.2c.1 // ain-2 // Protein AIN-2 // --- // 172076 /// NM_059019 // ain-2 // Protein AIN-2 // --- // 172076 /// NM_001025786 // ain-2 // Protein AIN-2 // --- // 172076 /// NM_059020 // ain-2 // Protein AIN-2 // --- // 172076 B0041.2a.2 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:4653471:4659518:1 gene:B0041.2 transcript:B0041.2a.2 description:Protein AIN-2, isoform a // chrI // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// B0041.2c.2 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:4653471:4659518:1 gene:B0041.2 transcript:B0041.2c.2 description:Protein AIN-2, isoform a // chrI // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// B0041.2d // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:4653527:4659518:1 gene:B0041.2 transcript:B0041.2d description:Protein AIN-2, isoform a // chrI // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// B0041.2b // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:4653471:4659518:1 gene:B0041.2 transcript:B0041.2b description:Protein AIN-2, isoform a // chrI // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NM_001262753 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein AIN-2, isoform d. // chrI // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// B0041.2a.1 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:4655349:4659518:1 gene:B0041.2 transcript:B0041.2a.1 description:Protein AIN-2, isoform a // chrI // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// B0041.2c.1 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:4655349:4659518:1 gene:B0041.2 transcript:B0041.2c.1 description:Protein AIN-2, isoform a // chrI // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_059019 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein AIN-2, isoform a (ain-2) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NM_001025786 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein AIN-2, isoform c (ain-2) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NM_059020 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein AIN-2, isoform b (ain-2) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 B0041.2a.2 // H2KY59 /// B0041.2c.2 // H2KY60 /// B0041.2d // H2KY58 /// B0041.2d // H2KY59 /// B0041.2b // Q95R18 /// NM_001262753 // H2KY58 /// B0041.2a.1 // H2KY59 /// B0041.2c.1 // H2KY60 /// NM_059019 // H2KY59 /// NM_001025786 // H2KY60 /// NM_059020 // Q95R18 B0041.2a.2 // Cel.6046 // embryo| L1 larva /// B0041.2a.2 // Cel.38457 // --- /// B0041.2c.2 // Cel.6046 // embryo| L1 larva /// B0041.2c.2 // Cel.38457 // --- /// B0041.2d // Cel.6046 // embryo| L1 larva /// B0041.2d // Cel.38457 // --- /// B0041.2b // Cel.6046 // embryo| L1 larva /// B0041.2b // Cel.38457 // --- /// NM_001262753 // Cel.6046 // embryo| L1 larva /// B0041.2a.1 // Cel.6046 // embryo| L1 larva /// B0041.2a.1 // Cel.38457 // --- /// B0041.2c.1 // Cel.6046 // embryo| L1 larva /// B0041.2c.1 // Cel.38457 // --- /// NM_059019 // Cel.6046 // embryo| L1 larva /// NM_001025786 // Cel.6046 // embryo| L1 larva /// NM_059020 // Cel.6046 // embryo| L1 larva 1 main chrI(+):4653472-4659519
18450840 18450840 chrI + 4644438 4645627 25 B0041.3 // B0041.3 // Protein B0041.3 // --- // 172073 /// NM_059014 // B0041.3 // Protein B0041.3 // --- // 172073 B0041.3 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:4644437:4645626:1 gene:B0041.3 transcript:B0041.3 description:Protein B0041.3 // chrI // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_059014 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein B0041.3 (B0041.3) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 B0041.3 // O02055 /// NM_059014 // O02055 B0041.3 // Cel.19320 // --- /// NM_059014 // Cel.19320 // --- 1 main chrI(+):4644438-4645627
18450845 18450845 chrI + 4647319 4648279 25 B0041.8.1 // B0041.8 // Protein B0041.8 // --- // 259374 /// B0041.8.2 // B0041.8 // Protein B0041.8 // --- // 259374 /// NM_059016 // B0041.8 // Protein B0041.8 // --- // 259374 B0041.8.1 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:4647318:4648278:1 gene:B0041.8 transcript:B0041.8.1 description:Protein B0041.8 // chrI // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// B0041.8.2 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:4647424:4648275:1 gene:B0041.8 transcript:B0041.8.2 description:Protein B0041.8 // chrI // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NM_059016 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein B0041.8 (B0041.8) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 B0041.8.1 // Q95R19 /// B0041.8.2 // Q95R19 /// NM_059016 // Q95R19 B0041.8.1 // Cel.19317 // L1 larva /// B0041.8.2 // Cel.19317 // L1 larva /// NM_059016 // Cel.19317 // L1 larva 1 main chrI(+):4647319-4648279
18450851 18450851 chrI + 10708352 10710364 25 B0205.10.2 // B0205.10 // Protein B0205.10 // --- // 172973 /// B0205.10.1 // B0205.10 // Protein B0205.10 // --- // 172973 /// NM_060403 // B0205.10 // Protein B0205.10 // --- // 172973 B0205.10.2 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:10708363:10710375:1 gene:B0205.10 transcript:B0205.10.2 description:Protein B0205.10 // chrI // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// B0205.10.1 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:10708404:10710375:1 gene:B0205.10 transcript:B0205.10.1 description:Protein B0205.10 // chrI // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_060403 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein B0205.10 (B0205.10) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 B0205.10.2 // O61747 /// B0205.10.1 // O61747 /// NM_060403 // O61747 B0205.10.2 // Cel.19311 // L4 larva /// B0205.10.2 // Cel.38889 // L4 larva /// B0205.10.1 // Cel.19311 // L4 larva /// B0205.10.1 // Cel.38889 // L4 larva /// NM_060403 // Cel.19311 // L4 larva 1 main chrI(+):10708352-10710364
18450859 18450859 chrI + 10730456 10730701 22 B0205.12 // B0205.12 // Protein B0205.12 // --- // 3565131 /// NM_001025788 // B0205.12 // Protein B0205.12 // --- // 3565131 B0205.12 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:10730467:10730712:1 gene:B0205.12 transcript:B0205.12 description:Protein B0205.12 // chrI // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_001025788 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein B0205.12 (B0205.12) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 B0205.12 // Q4W4Z5 /// NM_001025788 // Q4W4Z5 B0205.12 // Cel.29744 // --- /// NM_001025788 // Cel.29744 // --- 1 main chrI(+):10730456-10730701
18450863 18450863 chrI + 10726907 10727340 24 NM_001047166 // B0205.14 // Protein B0205.14 // --- // 4363000 /// B0205.14 // B0205.14 // Protein B0205.14 // --- // 4363000 NM_001047166 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein B0205.14 (B0205.14) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// B0205.14 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:10726918:10727351:1 gene:B0205.14 transcript:B0205.14 description:Protein B0205.14 // chrI // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 NM_001047166 // Q336L2 /// B0205.14 // Q336L2 NM_001047166 // Cel.33939 // --- /// B0205.14 // Cel.33939 // --- 1 main chrI(+):10726907-10727340
18450866 18450866 chrI + 10740207 10740579 22 B0205.5 // B0205.5 // Protein B0205.5 // --- // 181832 /// NM_060412 // B0205.5 // Protein B0205.5 // --- // 181832 B0205.5 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:10740218:10740590:1 gene:B0205.5 transcript:B0205.5 description:Protein B0205.5 // chrI // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_060412 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein B0205.5 (B0205.5) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 B0205.5 // O61740 /// NM_060412 // O61740 B0205.5 // Cel.37012 // --- /// NM_060412 // Cel.37012 // --- 1 main chrI(+):10740207-10740579
18450870 18450870 chrI + 10736686 10739900 30 B0205.6 // B0205.6 // Protein B0205.6 // --- // 172979 /// NM_060411 // B0205.6 // Protein B0205.6 // --- // 172979 B0205.6 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:10736697:10739911:1 gene:B0205.6 transcript:B0205.6 description:Protein B0205.6 // chrI // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_060411 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein B0205.6 (B0205.6) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 B0205.6 // O61741 /// NM_060411 // O61741 B0205.6 // Cel.17271 // embryo| L1 larva| L4 larva /// NM_060411 // Cel.17271 // embryo| L1 larva| L4 larva 1 main chrI(+):10736686-10739900
18450883 18450883 chrI + 10734011 10736596 27 B0205.7 // kin-3 // Protein KIN-3 // --- // 172978 /// NM_060410 // kin-3 // Protein KIN-3 // --- // 172978 B0205.7 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:10734022:10736607:1 gene:B0205.7 transcript:B0205.7 description:Casein kinase II subunit alpha // chrI // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_060410 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein KIN-3 (kin-3) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 NM_060410 // P18334 B0205.7 // Cel.17822 // embryo| L1 larva| L4 larva /// B0205.7 // Cel.33270 // embryo /// NM_060410 // Cel.17822 // embryo| L1 larva| L4 larva 1 main chrI(+):10734011-10736596
18450893 18450893 chrI + 10720815 10723580 21 B0205.9 // B0205.9 // Protein B0205.9 // --- // 172975 /// NM_060405 // B0205.9 // Protein B0205.9 // --- // 172975 B0205.9 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:10720826:10723591:1 gene:B0205.9 transcript:B0205.9 description:Protein B0205.9 // chrI // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NM_060405 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein B0205.9 (B0205.9) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 B0205.9 // O61745 /// NM_060405 // O61745 B0205.9 // Cel.5711 // embryo| L1 larva /// NM_060405 // Cel.5711 // embryo| L1 larva 1 main chrI(+):10720815-10723580
18450902 18450902 chrI + 5965064 5967213 25 NM_059321 // B0207.1 // Protein B0207.1 // --- // 181834 /// B0207.1 // B0207.1 // Protein B0207.1 // --- // 181834 NM_059321 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein B0207.1 (B0207.1) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// B0207.1 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:5965062:5967211:1 gene:B0207.1 transcript:B0207.1 description:Protein B0207.1 // chrI // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 NM_059321 // O01435 /// B0207.1 // O01435 NM_059321 // Cel.37011 // --- /// B0207.1 // Cel.37011 // --- 1 main chrI(+):5965064-5967213
18450911 18450911 chrI + 5968743 5968965 22 NR_050154 // B0207.13 // ncRNA // --- // 13180412 NR_050154 // RefSeq // Caenorhabditis elegans RNA transcript B0207.13 (B0207.13), ncRNA. // chrI // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// B0207.13 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:5968741:5968963:1 gene:B0207.13 transcript:B0207.13 description: // chrI // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 --- --- 1 main chrI(+):5968743-5968965
18450913 18450913 chrI + 5969292 5969356 25 NR_050155 // B0207.15 // ncRNA // --- // 13180413 NR_050155 // RefSeq // Caenorhabditis elegans RNA transcript B0207.15 (B0207.15), ncRNA. // chrI // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// B0207.15 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:5969290:5969354:1 gene:B0207.15 transcript:B0207.15 description: // chrI // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 --- --- 1 main chrI(+):5969292-5969356
18450915 18450915 chrI + 5955032 5956885 24 B0207.2.1 // B0207.2 // Protein B0207.2 // --- // 181835 /// B0207.2.2 // B0207.2 // Protein B0207.2 // --- // 181835 /// NM_059317 // B0207.2 // Protein B0207.2 // --- // 181835 B0207.2.1 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:5955030:5956883:1 gene:B0207.2 transcript:B0207.2.1 description:Protein B0207.2 // chrI // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// B0207.2.2 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:5955031:5956883:1 gene:B0207.2 transcript:B0207.2.2 description:Protein B0207.2 // chrI // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_059317 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein B0207.2 (B0207.2) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 B0207.2.1 // O01431 /// B0207.2.2 // O01431 /// NM_059317 // O01431 B0207.2.1 // Cel.20360 // L1 larva /// B0207.2.2 // Cel.20360 // L1 larva /// NM_059317 // Cel.20360 // L1 larva 1 main chrI(+):5955032-5956885
18450924 18450924 chrI + 5942421 5945539 18 B0207.3b // gpa-14 // Protein GPA-14 // --- // 172269 /// NM_001025795 // gpa-14 // Protein GPA-14 // --- // 172269 /// B0207.3a // gpa-14 // Protein GPA-14 // --- // 172269 /// NM_001025794 // gpa-14 // Protein GPA-14 // --- // 172269 /// AY008136 // gpa-14 // Protein GPA-14 // --- // 172269 B0207.3b // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:5942419:5945537:1 gene:B0207.3 transcript:B0207.3b description:Guanine nucleotide-binding protein alpha-14 subunit // chrI // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NM_001025795 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein GPA-14, isoform b. // chrI // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// B0207.3a // ENSEMBL // cdna:known chromosome:WBcel235:I:5942577:5945537:1 gene:B0207.3 transcript:B0207.3a description:Guanine nucleotide-binding protein alpha-14 subunit // chrI // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// NM_001025794 // RefSeq // Caenorhabditis elegans Protein GPA-14, isoform a (gpa-14) mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// AY008136 // GenBank // Caenorhabditis elegans isolate GPA-14 heterotrimeric G protein alpha subunit mRNA, complete cds. // chrI // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 B0207.3b // Q9BIG2 /// NM_001025795 // Q9BIG2 /// B0207.3a // Q9BIG2 /// NM_001025794 // Q9BIG2 /// AY008136 // Q9BIG2 B0207.3b // Cel.18557 // --- /// NM_001025795 // Cel.18557 // --- /// B0207.3a // Cel.18557 // --- /// NM_001025794 // Cel.18557 // --- /// AY008136 // Cel.18557 // --- 1 main chrI(+):5942421-5945539

Total number of rows: 29317

Table truncated, full table size 22201 Kbytes.




Download family Format
SOFT formatted family file(s) SOFTHelp
MINiML formatted family file(s) MINiMLHelp

Supplementary file Size Download File type/resource
GPL19230_EleGene-1_0-st.mps.zip.gz 428.4 Kb (ftp)(http) ZIP
GPL19230_EleGene-1_0-st.pgf.zip.gz 11.1 Mb (ftp)(http) ZIP

| NLM | NIH | GEO Help | Disclaimer | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap