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4.
rs1491169787 has merged into rs70956001 [Homo sapiens]- Variant type:
- DELINS
- Alleles:
- TGTGTGTGTGTG>-,TGTG,TGTGTG,TGTGTGTG,TGTGTGTGTG,TGTGTGTGTGTGTG,TGTGTGTGTGTGTGTG,TGTGTGTGTGTGTGTGTG,TGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
[Show Flanks]
- Chromosome:
- 4:99349816
(GRCh38)
4:100270973
(GRCh37)
- Canonical SPDI:
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- Gene:
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- Functional Consequence:
- intron_variant
- Validated:
- by frequency,by alfa,by cluster
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(
ALFA)
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7.
rs1491001235 [Homo sapiens]- Variant type:
- SNV
- Alleles:
- C>A
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- 4:99336692
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(GRCh37)
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- Gene:
- ADH1C (Varview)
- Functional Consequence:
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- Validated:
- by frequency,by alfa,by cluster
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(
ALFA)
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(Estonian)
- HGVS:
8.
rs1490848680 [Homo sapiens]- Variant type:
- SNV
- Alleles:
- C>T
[Show Flanks]
- Chromosome:
- 4:99345039
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- Gene:
- ADH1C (Varview)
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- Validated:
- by frequency,by alfa
- MAF:
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(
ALFA)
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(TOPMED)
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10.
rs1490257892 [Homo sapiens]- Variant type:
- SNV
- Alleles:
- C>T
[Show Flanks]
- Chromosome:
- 4:99353269
(GRCh38)
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- Canonical SPDI:
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- ADH1C (Varview)
- Functional Consequence:
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- Validated:
- by frequency,by alfa,by cluster
- MAF:
T=0./0
(
ALFA)
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(TOPMED)
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(GnomAD)
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11.
rs1490237785 [Homo sapiens]- Variant type:
- SNV
- Alleles:
- T>C
[Show Flanks]
- Chromosome:
- 4:99354872
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ALFA)
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(TOPMED)
- HGVS:
12.
rs1490180617 [Homo sapiens]- Variant type:
- SNV
- Alleles:
- T>A
[Show Flanks]
- Chromosome:
- 4:99339133
(GRCh38)
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- Gene:
- ADH1C (Varview)
- Functional Consequence:
- intron_variant
- Validated:
- by frequency,by alfa,by cluster
- MAF:
A=0./0
(
ALFA)
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(GnomAD)
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(TOPMED)
- HGVS:
13.
rs1490155257 has merged into rs35124782 [Homo sapiens]- Variant type:
- DELINS
- Alleles:
- TATATATATATATATATATATATATATATATATATATA>-,TATA,TATATA,TATATATA,TATATATATA,TATATATATATA,TATATATATATATA,TATATATATATATATA,TATATATATATATATATA,TATATATATATATATATATA,TATATATATATATATATATATA,TATATATATATATATATATATATA,TATATATATATATATATATATATATA,TATATATATATATATATATATATATATA,TATATATATATATATATATATATATATATA,TATATATATATATATATATATATATATATATA,TATATATATATATATATATATATATATATATATA,TATATATATATATATATATATATATATATATATATA,TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA,TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA,TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA,TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA,TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA,TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA,TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA,TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA
[Show Flanks]
- Chromosome:
- 4:99338408
(GRCh38)
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- Gene:
- ADH1C (Varview)
- Functional Consequence:
- intron_variant
- Validated:
- by frequency,by alfa,by cluster
- MAF:
- HGVS:
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14.
rs1490147619 [Homo sapiens]- Variant type:
- SNV
- Alleles:
- T>A
[Show Flanks]
- Chromosome:
- 4:99337591
(GRCh38)
4:100258748
(GRCh37)
- Canonical SPDI:
- NC_000004.12:99337590:T:A
- Gene:
- ADH1C (Varview)
- Functional Consequence:
- intron_variant
- Validated:
- by frequency,by alfa,by cluster
- MAF:
A=0./0
(
ALFA)
A=0.000029/4
(GnomAD)
- HGVS:
15.
rs1490116919 [Homo sapiens]- Variant type:
- SNV
- Alleles:
- G>C
[Show Flanks]
- Chromosome:
- 4:99352679
(GRCh38)
4:100273836
(GRCh37)
- Canonical SPDI:
- NC_000004.12:99352678:G:C
- Gene:
- ADH1C (Varview)
- Functional Consequence:
- non_coding_transcript_variant,5_prime_UTR_variant
- Validated:
- by frequency,by alfa
- MAF:
C=0./0
(
ALFA)
C=0.000008/2
(TOPMED)
- HGVS:
16.
rs1489952763 [Homo sapiens]- Variant type:
- INS
- Alleles:
- ->C
[Show Flanks]
- Chromosome:
- 4:99352275
(GRCh38)
4:100273433
(GRCh37)
- Canonical SPDI:
- NC_000004.12:99352275::C
- Gene:
- ADH1C (Varview)
- Functional Consequence:
- intron_variant
- Validated:
- by frequency,by alfa
- MAF:
C=0./0
(
ALFA)
C=0.000004/1
(TOPMED)
- HGVS:
17.
rs1489707793 [Homo sapiens]- Variant type:
- DEL
- Alleles:
- T>-
[Show Flanks]
- Chromosome:
- 4:99354080
(GRCh38)
4:100275237
(GRCh37)
- Canonical SPDI:
- NC_000004.12:99354079:T:
- Gene:
- ADH1C (Varview)
- Functional Consequence:
- upstream_transcript_variant,2KB_upstream_variant
- Validated:
- by frequency,by alfa,by cluster
- MAF:
-=0.000084/1
(
ALFA)
-=0.00005/7
(GnomAD)
-=0.000053/14
(TOPMED)
- HGVS:
18.
rs1489668643 [Homo sapiens]- Variant type:
- SNV
- Alleles:
- A>G
[Show Flanks]
- Chromosome:
- 4:99346543
(GRCh38)
4:100267700
(GRCh37)
- Canonical SPDI:
- NC_000004.12:99346542:A:G
- Gene:
- ADH1C (Varview)
- Functional Consequence:
- intron_variant
- Validated:
- by frequency,by alfa,by cluster
- MAF:
G=0./0
(
ALFA)
G=0.000008/2
(TOPMED)
G=0.000014/2
(GnomAD)
- HGVS:
20.
rs1489211393 [Homo sapiens]- Variant type:
- SNV
- Alleles:
- G>T
[Show Flanks]
- Chromosome:
- 4:99336860
(GRCh38)
4:100258017
(GRCh37)
- Canonical SPDI:
- NC_000004.12:99336859:G:T
- Gene:
- ADH1C (Varview)
- Functional Consequence:
- intron_variant
- Validated:
- by frequency,by alfa,by cluster
- MAF:
T=0./0
(
ALFA)
T=0.000004/1
(TOPMED)
T=0.000007/1
(GnomAD)
- HGVS: