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3.

rs1490406624 [Homo sapiens]
    Variant type:
    SNV
    Alleles:
    G>A,T [Show Flanks]
    Chromosome:
    11:122090219 (GRCh38)
    11:121960927 (GRCh37)
    Canonical SPDI:
    NC_000011.10:122090218:G:A,NC_000011.10:122090218:G:T
    Gene:
    MIR100HG (Varview)
    Functional Consequence:
    non_coding_transcript_variant,intron_variant
    Validated:
    by frequency,by alfa,by cluster
    MAF:
    A=0./0 (ALFA)
    A=0.00006/2 (GnomAD)
    A=0.01745/51 (KOREAN)
    HGVS:
    NC_000011.10:g.122090219G>A, NC_000011.10:g.122090219G>T, NC_000011.9:g.121960927G>A, NC_000011.9:g.121960927G>T, NR_024430.2:n.2013C>T, NR_024430.2:n.2013C>A, NR_024430.1:n.1966C>T, NR_024430.1:n.1966C>A, NR_137190.1:n.2338C>T, NR_137190.1:n.2338C>A, NR_137191.1:n.2317C>T, NR_137191.1:n.2317C>A, NR_137189.1:n.2305C>T, NR_137189.1:n.2305C>A, NR_137175.1:n.2284C>T, NR_137175.1:n.2284C>A, NR_137192.1:n.2177C>T, NR_137192.1:n.2177C>A, NR_137196.1:n.2068C>T, NR_137196.1:n.2068C>A, NR_137195.1:n.2047C>T, NR_137195.1:n.2047C>A, NR_137180.1:n.2025C>T, NR_137180.1:n.2025C>A, NR_137193.1:n.2004C>T, NR_137193.1:n.2004C>A, NR_137176.1:n.1995C>T, NR_137176.1:n.1995C>A, NR_137182.1:n.1992C>T, NR_137182.1:n.1992C>A, NR_137177.1:n.1974C>T, NR_137177.1:n.1974C>A, NR_137179.1:n.1967C>T, NR_137179.1:n.1967C>A, NR_137181.1:n.1910C>T, NR_137181.1:n.1910C>A, NR_137183.1:n.1901C>T, NR_137183.1:n.1901C>A, NR_137185.1:n.1880C>T, NR_137185.1:n.1880C>A, NR_137194.1:n.1879C>T, NR_137194.1:n.1879C>A, NR_137188.1:n.1858C>T, NR_137188.1:n.1858C>A, NR_137184.1:n.1819C>T, NR_137184.1:n.1819C>A, NR_137186.1:n.1789C>T, NR_137186.1:n.1789C>A, NR_137187.1:n.1768C>T, NR_137187.1:n.1768C>A
    4.

    rs1489977830 [Homo sapiens]
      Variant type:
      SNV
      Alleles:
      G>A,T [Show Flanks]
      Chromosome:
      11:122090922 (GRCh38)
      11:121961630 (GRCh37)
      Canonical SPDI:
      NC_000011.10:122090921:G:A,NC_000011.10:122090921:G:T
      Gene:
      MIR100HG (Varview)
      Functional Consequence:
      non_coding_transcript_variant,intron_variant
      Validated:
      by frequency,by alfa,by cluster
      MAF:
      T=0./0 (ALFA)
      A=0.000004/1 (TOPMED)
      HGVS:
      NC_000011.10:g.122090922G>A, NC_000011.10:g.122090922G>T, NC_000011.9:g.121961630G>A, NC_000011.9:g.121961630G>T, NR_024430.2:n.1310C>T, NR_024430.2:n.1310C>A, NR_024430.1:n.1263C>T, NR_024430.1:n.1263C>A, NR_137190.1:n.1635C>T, NR_137190.1:n.1635C>A, NR_137191.1:n.1614C>T, NR_137191.1:n.1614C>A, NR_137189.1:n.1602C>T, NR_137189.1:n.1602C>A, NR_137175.1:n.1581C>T, NR_137175.1:n.1581C>A, NR_137192.1:n.1474C>T, NR_137192.1:n.1474C>A, NR_137196.1:n.1365C>T, NR_137196.1:n.1365C>A, NR_137195.1:n.1344C>T, NR_137195.1:n.1344C>A, NR_137180.1:n.1322C>T, NR_137180.1:n.1322C>A, NR_137193.1:n.1301C>T, NR_137193.1:n.1301C>A, NR_137176.1:n.1292C>T, NR_137176.1:n.1292C>A, NR_137182.1:n.1289C>T, NR_137182.1:n.1289C>A, NR_137177.1:n.1271C>T, NR_137177.1:n.1271C>A, NR_137179.1:n.1264C>T, NR_137179.1:n.1264C>A, NR_137181.1:n.1207C>T, NR_137181.1:n.1207C>A, NR_137183.1:n.1198C>T, NR_137183.1:n.1198C>A, NR_137185.1:n.1177C>T, NR_137185.1:n.1177C>A, NR_137194.1:n.1176C>T, NR_137194.1:n.1176C>A, NR_137188.1:n.1155C>T, NR_137188.1:n.1155C>A, NR_137184.1:n.1116C>T, NR_137184.1:n.1116C>A, NR_137186.1:n.1086C>T, NR_137186.1:n.1086C>A, NR_137187.1:n.1065C>T, NR_137187.1:n.1065C>A
      7.

      rs1487959723 [Homo sapiens]
        Variant type:
        SNV
        Alleles:
        A>G [Show Flanks]
        Chromosome:
        11:122105506 (GRCh38)
        11:121976214 (GRCh37)
        Canonical SPDI:
        NC_000011.10:122105505:A:G
        Gene:
        MIR100HG (Varview)
        Functional Consequence:
        non_coding_transcript_variant,genic_upstream_transcript_variant,intron_variant
        Validated:
        by frequency,by alfa,by cluster
        MAF:
        G=0./0 (ALFA)
        G=0.000007/1 (GnomAD)
        G=0.000008/2 (TOPMED)
        HGVS:
        8.

        rs1485985208 [Homo sapiens]
          Variant type:
          SNV
          Alleles:
          G>A [Show Flanks]
          Chromosome:
          11:122105485 (GRCh38)
          11:121976193 (GRCh37)
          Canonical SPDI:
          NC_000011.10:122105484:G:A
          Gene:
          MIR100HG (Varview)
          Functional Consequence:
          non_coding_transcript_variant,genic_upstream_transcript_variant,intron_variant
          HGVS:
          9.

          rs1485077726 [Homo sapiens]
            Variant type:
            SNV
            Alleles:
            A>G,T [Show Flanks]
            Chromosome:
            11:122090366 (GRCh38)
            11:121961074 (GRCh37)
            Canonical SPDI:
            NC_000011.10:122090365:A:G,NC_000011.10:122090365:A:T
            Gene:
            MIR100HG (Varview)
            Functional Consequence:
            non_coding_transcript_variant,intron_variant
            Validated:
            by frequency,by alfa,by cluster
            MAF:
            T=0.00022/1 (ALFA)
            G=0.00004/1 (TOMMO)
            T=0.00022/1 (Estonian)
            HGVS:
            NC_000011.10:g.122090366A>G, NC_000011.10:g.122090366A>T, NC_000011.9:g.121961074A>G, NC_000011.9:g.121961074A>T, NR_024430.2:n.1866T>C, NR_024430.2:n.1866T>A, NR_024430.1:n.1819T>C, NR_024430.1:n.1819T>A, NR_137190.1:n.2191T>C, NR_137190.1:n.2191T>A, NR_137191.1:n.2170T>C, NR_137191.1:n.2170T>A, NR_137189.1:n.2158T>C, NR_137189.1:n.2158T>A, NR_137175.1:n.2137T>C, NR_137175.1:n.2137T>A, NR_137192.1:n.2030T>C, NR_137192.1:n.2030T>A, NR_137196.1:n.1921T>C, NR_137196.1:n.1921T>A, NR_137195.1:n.1900T>C, NR_137195.1:n.1900T>A, NR_137180.1:n.1878T>C, NR_137180.1:n.1878T>A, NR_137193.1:n.1857T>C, NR_137193.1:n.1857T>A, NR_137176.1:n.1848T>C, NR_137176.1:n.1848T>A, NR_137182.1:n.1845T>C, NR_137182.1:n.1845T>A, NR_137177.1:n.1827T>C, NR_137177.1:n.1827T>A, NR_137179.1:n.1820T>C, NR_137179.1:n.1820T>A, NR_137181.1:n.1763T>C, NR_137181.1:n.1763T>A, NR_137183.1:n.1754T>C, NR_137183.1:n.1754T>A, NR_137185.1:n.1733T>C, NR_137185.1:n.1733T>A, NR_137194.1:n.1732T>C, NR_137194.1:n.1732T>A, NR_137188.1:n.1711T>C, NR_137188.1:n.1711T>A, NR_137184.1:n.1672T>C, NR_137184.1:n.1672T>A, NR_137186.1:n.1642T>C, NR_137186.1:n.1642T>A, NR_137187.1:n.1621T>C, NR_137187.1:n.1621T>A
            11.

            rs1482309292 [Homo sapiens]
              Variant type:
              SNV
              Alleles:
              A>G [Show Flanks]
              Chromosome:
              11:122105552 (GRCh38)
              11:121976260 (GRCh37)
              Canonical SPDI:
              NC_000011.10:122105551:A:G
              Gene:
              MIR100HG (Varview)
              Functional Consequence:
              intron_variant,genic_upstream_transcript_variant,non_coding_transcript_variant
              Validated:
              by frequency,by alfa
              MAF:
              G=0./0 (ALFA)
              G=0.000007/1 (GnomAD)
              HGVS:
              14.

              rs1480792324 [Homo sapiens]
                Variant type:
                SNV
                Alleles:
                T>A,C [Show Flanks]
                Chromosome:
                11:122090723 (GRCh38)
                11:121961431 (GRCh37)
                Canonical SPDI:
                NC_000011.10:122090722:T:A,NC_000011.10:122090722:T:C
                Gene:
                MIR100HG (Varview)
                Functional Consequence:
                intron_variant,non_coding_transcript_variant
                Validated:
                by frequency,by alfa,by cluster
                MAF:
                A=0.000071/1 (ALFA)
                A=0.000008/2 (TOPMED)
                HGVS:
                NC_000011.10:g.122090723T>A, NC_000011.10:g.122090723T>C, NC_000011.9:g.121961431T>A, NC_000011.9:g.121961431T>C, NR_024430.2:n.1509A>T, NR_024430.2:n.1509A>G, NR_024430.1:n.1462A>T, NR_024430.1:n.1462A>G, NR_137190.1:n.1834A>T, NR_137190.1:n.1834A>G, NR_137191.1:n.1813A>T, NR_137191.1:n.1813A>G, NR_137189.1:n.1801A>T, NR_137189.1:n.1801A>G, NR_137175.1:n.1780A>T, NR_137175.1:n.1780A>G, NR_137192.1:n.1673A>T, NR_137192.1:n.1673A>G, NR_137196.1:n.1564A>T, NR_137196.1:n.1564A>G, NR_137195.1:n.1543A>T, NR_137195.1:n.1543A>G, NR_137180.1:n.1521A>T, NR_137180.1:n.1521A>G, NR_137193.1:n.1500A>T, NR_137193.1:n.1500A>G, NR_137176.1:n.1491A>T, NR_137176.1:n.1491A>G, NR_137182.1:n.1488A>T, NR_137182.1:n.1488A>G, NR_137177.1:n.1470A>T, NR_137177.1:n.1470A>G, NR_137179.1:n.1463A>T, NR_137179.1:n.1463A>G, NR_137181.1:n.1406A>T, NR_137181.1:n.1406A>G, NR_137183.1:n.1397A>T, NR_137183.1:n.1397A>G, NR_137185.1:n.1376A>T, NR_137185.1:n.1376A>G, NR_137194.1:n.1375A>T, NR_137194.1:n.1375A>G, NR_137188.1:n.1354A>T, NR_137188.1:n.1354A>G, NR_137184.1:n.1315A>T, NR_137184.1:n.1315A>G, NR_137186.1:n.1285A>T, NR_137186.1:n.1285A>G, NR_137187.1:n.1264A>T, NR_137187.1:n.1264A>G
                15.

                rs1479717841 [Homo sapiens]
                  Variant type:
                  SNV
                  Alleles:
                  G>A [Show Flanks]
                  Chromosome:
                  11:122105241 (GRCh38)
                  11:121975949 (GRCh37)
                  Canonical SPDI:
                  NC_000011.10:122105240:G:A
                  Gene:
                  MIR100HG (Varview)
                  Functional Consequence:
                  intron_variant,genic_upstream_transcript_variant,non_coding_transcript_variant
                  Validated:
                  by frequency,by alfa
                  MAF:
                  A=0./0 (ALFA)
                  A=0.000004/1 (TOPMED)
                  HGVS:
                  16.

                  rs1479410111 [Homo sapiens]
                    Variant type:
                    SNV
                    Alleles:
                    T>C [Show Flanks]
                    Chromosome:
                    11:122091721 (GRCh38)
                    11:121962429 (GRCh37)
                    Canonical SPDI:
                    NC_000011.10:122091720:T:C
                    Gene:
                    MIR100HG (Varview)
                    Functional Consequence:
                    intron_variant,splice_acceptor_variant,non_coding_transcript_variant
                    Validated:
                    by frequency,by alfa,by cluster
                    MAF:
                    C=0./0 (ALFA)
                    C=0.000007/1 (GnomAD)
                    C=0.000011/3 (TOPMED)
                    HGVS:
                    18.

                    rs1478823862 [Homo sapiens]
                      Variant type:
                      SNV
                      Alleles:
                      C>A,T [Show Flanks]
                      Chromosome:
                      11:122090908 (GRCh38)
                      11:121961616 (GRCh37)
                      Canonical SPDI:
                      NC_000011.10:122090907:C:A,NC_000011.10:122090907:C:T
                      Gene:
                      MIR100HG (Varview)
                      Functional Consequence:
                      intron_variant,non_coding_transcript_variant
                      Validated:
                      by frequency,by alfa,by cluster
                      MAF:
                      A=0./0 (ALFA)
                      A=0.000007/1 (GnomAD)
                      A=0.000008/2 (TOPMED)
                      HGVS:
                      NC_000011.10:g.122090908C>A, NC_000011.10:g.122090908C>T, NC_000011.9:g.121961616C>A, NC_000011.9:g.121961616C>T, NR_024430.2:n.1324G>T, NR_024430.2:n.1324G>A, NR_024430.1:n.1277G>T, NR_024430.1:n.1277G>A, NR_137190.1:n.1649G>T, NR_137190.1:n.1649G>A, NR_137191.1:n.1628G>T, NR_137191.1:n.1628G>A, NR_137189.1:n.1616G>T, NR_137189.1:n.1616G>A, NR_137175.1:n.1595G>T, NR_137175.1:n.1595G>A, NR_137192.1:n.1488G>T, NR_137192.1:n.1488G>A, NR_137196.1:n.1379G>T, NR_137196.1:n.1379G>A, NR_137195.1:n.1358G>T, NR_137195.1:n.1358G>A, NR_137180.1:n.1336G>T, NR_137180.1:n.1336G>A, NR_137193.1:n.1315G>T, NR_137193.1:n.1315G>A, NR_137176.1:n.1306G>T, NR_137176.1:n.1306G>A, NR_137182.1:n.1303G>T, NR_137182.1:n.1303G>A, NR_137177.1:n.1285G>T, NR_137177.1:n.1285G>A, NR_137179.1:n.1278G>T, NR_137179.1:n.1278G>A, NR_137181.1:n.1221G>T, NR_137181.1:n.1221G>A, NR_137183.1:n.1212G>T, NR_137183.1:n.1212G>A, NR_137185.1:n.1191G>T, NR_137185.1:n.1191G>A, NR_137194.1:n.1190G>T, NR_137194.1:n.1190G>A, NR_137188.1:n.1169G>T, NR_137188.1:n.1169G>A, NR_137184.1:n.1130G>T, NR_137184.1:n.1130G>A, NR_137186.1:n.1100G>T, NR_137186.1:n.1100G>A, NR_137187.1:n.1079G>T, NR_137187.1:n.1079G>A
                      19.

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