Conserved Protein Domain Family
XerC

?
COG4973: XerC 
Site-specific recombinase XerC [Replication, recombination and repair]
Statistics
?
PSSM-Id: 443998
Aligned: 350 rows
Threshold Bit Score: 72.6869
Created: 9-Feb-2022
Updated: 17-Oct-2022
Structure
?
Aligned Rows:
Sequence Alignment
?
Format: Row Display: Color Bits: Type Selection:
WP_106448476 349 NSFDahd------dvEA--V-Q--KW--FDLi-------------R---EK-SKATQIAYRRA----IERL-----Vww- 388
YP_234510      2 KPMTl---------pEL--T-Q--EY--ILThd-----------lR---PD-TVKIYWAATKS----YVRF--------- 37 
WP_041766334  20 FFDKr----------KM--L-S--DA--NHStfyigpaesymrtlS---DL-SQSTVRSYLRN----IAR---------- 64 
WP_004213846  82 QRMPpi--------dEA--I-E--AY--FTE--------------Re-tEL-SDSSLQNHHYQ----LKMF-----Rk-- 119
WP_013183005   5 MTLEvvqehkiesqaQAksLrDkiAWqkMEMlsld------siivEwleTL-SERTKVNYKSG----ISKLtelgiInp- 72 
WP_015320363  21 PSLQpla------psAG--V-D--RY--LDR--------------Ra-sEL-TPGTVDEYRRK----LDYV-----Ve-- 60 
WP_045929880  12 FDLPilgsqaadisaEA--LfD--TW--LQHq-------------Rp--PM-APSTQRVYRTL----WRRF-----Lq-- 58 
WP_075801075  10 WPLSww--------pEA----DrlAW--LLHctpgd----pfhddRp-gARhRTATLIALVKAygrwLAFL-----Asrg 65 
WP_089673097   1 MKLEpia------peTA--L-E--MY--LTD--------------Re-nEV-AQATLYSHRSR----LSHF-----Vr-- 40 
WP_108434996  16 LPLAlw--------pAA----DrtAW--DSLfvegdi---ldgtvGp-gAFwKPTTQINYRQSygrwLTFV-----Igqg 72 
WP_106448476 389 aL-HEKrv---pLSslS-TPDLLEFkafLrDppahwvqpeRgKggtggqdwrplKGp-----LNDKSMNL---------- 448
YP_234510     38 -Fgdc-----laCEt--tHRDMLDW---R-Rs-------eL-E-----------R-------ISKRSWNT---------- 69 
WP_041766334  65 -I-FDKniedfpWHqlD-QDVVIYI---L-Dn-------lT-K-----------TG------LAPGTVGS---------- 102
WP_004213846 120 wAwGAGdv--snVEelE-PLDLSRFrr------------yR-Sk-----------------sINTNTMYN---------- 156
WP_013183005  73 fIsl------qsFSlvNhDAAIDRIk-qLpD-------------------------------LKETT-KQ---------- 103
WP_015320363  61 fC-AIQgv--edLNdiD-GRFVDEYrv------------wR-Rd----------EAtdavesLGVKTMRD---------- 103
WP_045929880  59 aL-QDHkk---qYTqiK-PVDIRDF---L-Sn-------lD-E-----------VRr------pQRERYQqviarayeel 104
WP_075801075  66 wL--DPde--ppLArvT-RARLRAF---F-He-------lR-R-----------VG------NADHTVi----------- 100
WP_089673097  41 wC-DENev--gnLNqlT-GRMLHQYrl------------wR-Rd----------EGd-----IGVVTEKT---------- 78 
WP_108434996  73 lL-ANNqe--apWKrvT-PERVAAY---L-Aq-------lV-E-----------QD------MSSWTIw----------- 108
WP_106448476 449 -------TFAAVGAMF-SSWKEK---NY--IT-SNP---AF--GMA----GP---Kre-diTL-DvmRS-FT-----DHD 494
YP_234510     70 -------YSSHLRTIY-GYAIEH---GLleLV-VNP---LKntRVM----PP---Krp--------kKT-VA-----NDA 113
WP_041766334 103 -------YLSAIKGVC-LSALNK---KT--MS-PErhhlIN--IIK----KP---Kgsr--ikkEg-TL-LS-----AEN 150
WP_004213846 157 -------QLCVVRLFL-RFCFRM---GW--VD-ESL---PE--SIV----LPt--Rdga---arD--SK-ID-----PDR 200
WP_013183005 104 -------ARAALYISFtRYLSRRf-kGM--FSkATP---SRe-GNE---------KtffrvhekvvtEA-MN-----LQQ 154
WP_015320363 104 -------EMYLLQSFL-RYLEAI---NA--VR-PGV---TE--TVL----IPdlgPdtg---vrD--IE-LA-----PEQ 149
WP_045929880 105 crqdgrsENPALAPAI-NDPFKE---SW--RQ-APD---NQ--ATQ----FL---Svd--qCL-A--TI-KA-----LRS 154
WP_075801075 101 ------gRFSHLAMAL-AVIVPGaevSW--IR--RPd------GVSvhslLP---KntrtlVVpDg-QViLDwgvtmMRQ 159
WP_089673097  79 -------QMDTLRVFI-RWLESI---DA--VE-PDL---HT--KVL----SPtlsSgdn---vrT--EM-LE-----TER 124
WP_108434996 109 ------gRMAGLLCLI-EAMAPKedfGW--LR--RIv------RYYerqtVD---RrkkapRLqPs-HImLDwalrhIEN 167
WP_106448476 495 LA-VIgetfakLE------------DS--PA-------KRRLAAILRLLETTGLRREELETATWaamERarI-Dg-ATSE 550
YP_234510    114 SVrar----nwLRmltaeeratakrTE---It-----pAWFWLSVFETFYYTGIRLNALLCLRY---AD--V-Yl-RDRL 174
WP_041766334 151 IK-DL------IKscd------qdlNK--TK-------GVRDKAIIIILRGCGLRRTELINIRI---NR--I-Nf-TEKK 201
WP_004213846 201 VA-GL------LDdl---------eRY--QY-------ASTDHVILSLLWSCSLRIGGLRALDL---ND--V-Dl-DNRW 248
WP_013183005 155 WT-AF------FEe----------lEK---L-------NIRDALIGKIALQGGKRIREVLSLHS---EQ--I-Dw-KKRE 200
WP_015320363 150 VT-EI------LDyl---------gTY--RY-------ASREHVVWLLHCRTGRRPGAIHSLDV---AD--V-HlgDAPY 198
WP_045929880 155 RL-QV------LEl----------aSD---MtiaarwrEYRDMTIVAVMLGTGLRPVELGQLHP---CA--V-Gv-AKCT 207
WP_075801075 160 ARaR-------LEr----------gGDrnALt------AYRDGLLIVLLALCGRRLRSVSLLRP---GHe-LrQv---GE 209
WP_089673097 125 AE-QI------LSyf---------gKY--EY-------ASRPHIVVSLMWHTMMRVGAIHSLDL---ED--Y-Ns-DGQY 172
WP_108434996 168 AQhRA------VQh----------vGDr----------AYRNALIIGLLSCCPVRLANLTMIEI---DRh-LvRl---ST 214
WP_106448476 551 ewlLDV-----MG---KG-K--RKRKVP--------ITEAVREA-------------LEihrqdrvllaktkpklqfdva 598
YP_234510    175 ---IRVrge-----teKT-H--REFLIP--------IPDGLMAQ-------------LE--------------------- 201
WP_041766334 202 ---LTV-----VG---KS-Nk--EREIW--------FSDRVKEA-------------IS--------------------- 225
WP_004213846 249 ---ADLayrpeSEtplKNkRg-SEREIN--------LHGWVCDL-------------LR--------------------- 282
WP_013183005 201 ---ITFhq-------sKTrGvsKQTIIT--------YSESIMKQ-------------LK--------------------- 228
WP_015320363 199 ---LAFrhrpdQGtrlKNgQn-SEREIP--------IDEAVATV-------------LA--------------------- 232
WP_045929880 208 ---AESs---------ETdD--SDhEETalwrdgtlLLRLAGAAkrdvvvpvwcesiLR--------------------- 252
WP_075801075 210 c--FRVeftpaQT---KT-K--RRDRFG--------LHEGFTPW-------------MR--------------------- 239
WP_089673097 173 ---LEVvhrpeTKtpiKNaEg-GERHVA--------LSESISEL-------------LD--------------------- 206
WP_108434996 215 g--YVLrfapnET---KT-G--HLFSAP--------LSRELTAP-------------LD--------------------- 244
WP_106448476 599 fedmpligviddRWrahME-----------KQhyqrlasgspevtdSAQDaDq--DgAdkLRA--------K-Ga----- 651
YP_234510    202 ------------TL---MQa----------AKal------------rFQP-G---D-Q--LFnvnrfsghyR-Rh----e 232
WP_041766334 226 ------------DW---LGl----------INka-----------sLQIS-Dd--N-F--LFLra-----hKsGkiinqr 258
WP_004213846 283 ------------AW---INd---------rRP--------------SVTD-EfgrK-P--LLAt------kQ-Gr----- 308
WP_013183005 229 ------------DL---LG-----------EG-------------------E---G-Y--LFIt------tT-Gn----v 246
WP_015320363 233 ------------DY---IEd---------tRE--------------SVTD-EhgrD-P--LLTs------rH-Gr----- 258
WP_045929880 253 ------------SW---LIfsgaedasawvKDs------------rVFPG-S---R-Q--ISAa------rP-Qa----q 287
WP_075801075 240 ------------HY---LEv---------iRPal-----------lVGQR-Q---E-A--LWIg------rL-Ge----p 266
WP_089673097 207 ------------SW---ISd---------rRP--------------SITD-EkgrQ-P--LESt------sQ-Gr----- 232
WP_108434996 245 ------------QY---ISv---------vRPrl-----------lKGPS-H---A-R--LWVs------eR-Gt----p 271
WP_106448476 652 LSGSGIYAVLRAFfK--KcaaqdddpS-Gpf-----------------lkASTHWLRHTFAHH-ALD-A-TdKDVPVVQQ 708
YP_234510    233 MNSNQVEAMYKKLtA--M--------T-Gi-------------------rMTPHRFRHTIASE-LMT-LpE-RNIYLTKK 279
WP_041766334 259 ICSQTIFDIFQAKqK--L--------M-Mvk------------------kFGPHDFRRTYITE-LINdG-N-A-IEDIQG 305
WP_004213846 309 MSRSAIRVRVYKLtAcgNlgq---gcAcGstypa-----------ecddsVAPHDIRRSSISA-WLD-E-G-HDPNLLSG 370
WP_013183005 247 VMLTQISRNFARAgK--A--------A-Kip-----------------fkVTPHVLRASAVTY-LKQ-Q-G-FSDSDIMK 294
WP_015320363 259 LSKTAMRLYFYEWsRpcAvte---ncPhGkqidacsaaqkkheaskcpssQSSYAARHGHITQ-LRR-L-G-LPKSVVSE 331
WP_045929880 288 MNPATLARIVSKWgT--Kq------mD-Ll--------------------MTPQRLRNTFGAG-LIE-R-G-FSLPEIEE 334
WP_075801075 267 LSAQGIQTRIQRLsR--Q--------RfGi-------------------sFGPHRIRHSIVTTaALR-L-G-ATPSFGAA 314
WP_089673097 233 AHITTLRGDCYRStRpcEytg---ecPhDrsisdcdaae-ygsesecpssVSPHALRRGGISH-HLN-C-D-VPKDIVSD 304
WP_108434996 272 MSGRTIHEAVTVTtE--V--------AfGr-------------------sINLHLFRDCAATFvALE-D-P-EHIGIVSP 319
WP_106448476 709 LLGHS-SIN--TTLV----Y---VK---AD--PKARID-AV-------------------R 734
YP_234510    280 LLNHS-NIA--TTMD----Y---IE---PD--YDMMRE-VMnergkrpakisymakpdatl 324
WP_041766334 306 LVGHS-SPE--TTRV----Y---DL---NK--KRNLKK-IGqdivf--------------- 335
WP_004213846 371 R---V-DTStrTMEKh---YdvrSE---RE--KRELRKdAFni------------------ 401
WP_013183005 295 ITGHS-SGE--MIRA----Y---DKserADnpTKRVNL-VM-------------------- 324
WP_015320363 332 R---C-DVSeeIIEKh---YderSE---EE--RRKLHRdLLeev--------------reK 366
WP_045929880 335 IMGYApGAA--SAWRlqasW---LAw--LD--AQKT----Pdksvitdntqpe-------- 374
WP_075801075 315 VVGNT--PA--VAEg----Y---NH---AG--QCRAAA-LYaqvirerrrnngr------- 351
WP_089673097 305 R---A-NVSkdVLDTh---YdkrSE---QD--KMEQRRkYLnni----------------- 336
WP_108434996 320 LLGHV-DPR--AAERh---Y---IE---AN--QIVAGR-RLrssvaqarkilppskgkinK 365
| Disclaimer | Privacy statement | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap