Conserved Protein Domain Family
PRK06458

?
PRK06458: PRK06458 
hydrogenase 4 subunit F; Validated
Statistics
?
PSSM-Id: 235805
Aligned: 83 rows
Threshold Bit Score: 408.549
Created: 9-Dec-2010
Updated: 25-Oct-2021
Structure
?
Aligned Rows:
Sequence Alignment
?
Format: Row Display: Color Bits: Type Selection:
260845118   1 MSYS----VMFALLLLTPLLFSLLCFACRKrglsatctVTVLHSLGITLLLILALWVVQTAADAGEifaaglWLHIDGLG 76 
229582262   1 ------mnIEPILLLLIPIISNVGFFKLKL--------IKTLSVLSAVLTSIISIFLYFLAPik------nsFFFITKFT 60 
284997589   1 --MN----IEPILLLLIPIISNVGFFKLKL--------IKTLSVLSAVLTLIISIFLYFLAPik------nsFFFITKFT 60 
238619634   1 --MN----IEPILLLLIPIISNVGFFKLKL--------IKTLSVLSAVLTLIISIFLYFLAPik------nsFFFITKFT 60 
227827478   1 ------mnIEPILLLLIPIISNVGFFKLKL--------IKTLSVLSAVLTLIISIFLYFLAPik------nsFFFITKFT 60 
229584692   1 --MN----IEPILLLLIPIISNVGFFKLKL--------IKTLSVLSAVLTLIISIFLYFLAPik------nsFFFITKFT 60 
227830170   1 ------mnIEPILLLLIPIISNVGFFKLKL--------IKTLSVLSAVLTLIISIFLYFLAPik------nsFFFITKFT 60 
229578985   1 --MN----IEPILLLLIPIISNVGFFKLKL--------IKTLSVLSAVLTSIISIFLYFLAPik------nsFFFITKFT 60 
13542286    1 ---MipgeILAVLVVVIPGVVNITYRLG----------IKKATIVGASADLVVAGLMYFLRPQTG-------FFYIQDST 60 
48477899    4 WRSCvvemIIDIILMVMPLISII---------------FYKYNNYSSFASGIIAMFLLLFIKNSENi------FLIDSTS 62 
260845118  77 GLFLAILGVIGFLTGVYSIGYMRHEVAHGELSPVTLCDYYGFFHLFLFTMLLVVTSNNLIVMWAAIEATTLSSAFLVGIY 156
229582262  61 TFFLLMITSIYLLSTLYSMNYIK------PSKIVSERLYYILLNSFASSMLFTVIMNNYGLMWVGVELTTVTSALLIIAE 134
284997589  61 TFFLLVIASIYLLSTLYSMNYIK------PSKIVSERLYYILLNSFASSMLFTVIMNNYGLMWVGVELTTVTSALLIIAE 134
238619634  61 TFFLLVIASIYLLSTLYSMNYIK------PSKIVSERLYYILLNSFASSMLFTVIMNNYGLMWVGVELTTVTSALLIVAE 134
227827478  61 TFFLLVIASIYLLSTLYSMNYIK------PSKIVSERLYYILLNSFASSMLFTVIMNNYGLMWVGVELTTVTSALLIVAE 134
229584692  61 TFFLLVIASIYLLSTLYSMNYIK------PSKIVSERLYYILLNSFASSMLFTVIMNNYGLMWVGVELTTVTSALLIVAE 134
227830170  61 TFFLLVIASIYLLSTLYSMNYIK------PSKIVSERLYYILLNSFASSMLFTVIMNNYGLMWVGVELTTVTSALLIIAE 134
229578985  61 TFFLLMIASIYLLSTLYSMNYIK------PSKIVSERLYYILLNSFASSMLFTVIMNNYGLMWVGVELTTVTSALLIIAE 134
13542286   61 MLFIIMVLSVYLLSAIYSTRYLKGIEVMGIREPT----YYLLLNLFTASMLFSLEVNNYGLMWVGIEATTISSALLLITE 136
48477899   63 RIFIFMILAIYTASSIYGTKYIKKYASF-----ISYNTYFLLNSLFAFTMLFTVMINNYGFMWVGIEGTTISSALMVITE 137
260845118 157 GQRSSLEAAWKYIIICTVGVAFGLFGTVLVYANVASVMPQAEMaifwSEVLKQSSLLDPTLMLLAFVFVLIGFGTKTGLF 236
229582262 135 ASETSLEATWRYVIIVSAGVTLALFSIIFIYYNYHTLTV--------TEILTKPE--NNIITKLAVALALIGFGTKAGVF 204
284997589 135 ASETSLEATWRYIIIVSAGVTLALFSIIFIYYNYHTLTV--------TEILTKPE--NNIITKLAVALALIGFGTKAGVF 204
238619634 135 ASETSLEATWRYIIIVSAGVTLALFSIIFIYYNYHTLTV--------TEILTKPE--NNIITKLAVALALIGFGTKAGVF 204
227827478 135 ASETSLEATWRYIIIVSAGVTLALFSIIFIYYNYHTLTV--------TEILTKPE--NNIITKLAVALALIGFGTKAGVF 204
229584692 135 ASENSLEATWRYIIIVSAGVTLALFSIIFIYYNYHTLTV--------TEILTKPE--NNIITKLAVALALIGFGTKAGVF 204
227830170 135 ASETSLEATWRYIIIVSAGVTLALFSIIFIYYNYHTLTV--------TEILTKPE--NNIITKLAVALALIGFGTKAGVF 204
229578985 135 ASETSLEATWRYIIIVSAGVTLALFSIIFIYYNYHTLTV--------TEILTKPE--NNIITKLAVALALIGFGTKAGVF 204
13542286  137 KSETSLEATWRYIIIVSAGVTFAFISIILIYYTLGTLSVSTAI----------GSHVHSRIMVLAVSLALIGFGTKVGVF 206
48477899  138 GTETAKEATWRYIIIVSAGISIAFIAIILIYYSFHTLTV--------SLIINENK--KSILIALAVALSLIGFGTKAGIF 207
260845118 237 PMHAWLPDAHSEAPSPVSALLSAVLLNCALLVLIRYYIIicqaigsDFPNRLLLIFGMLSVAVAAFFILVQRDIKRLLAY 316
229582262 205 PMYTWLPDAHSEAPSPISALFSGVLLPAATYVVYMVYQV-------NPLTNIFVIFTTLSIITASIILTYQWHIKRMFAY 277
284997589 205 PMYTWLPDAHSEAPSPISALFSGVLLPAATYVVYMVYQV-------NPLTNIFVIFTTLSIITASIILTYQWHIKRMFAY 277
238619634 205 PMYTWLPDAHSEAPSPISALFSGVLLPAATYVVYMVYQV-------NPLTNIFVIFTTLSIITASIILTYQWHIKRMFAY 277
227827478 205 PMYTWLPDAHSEAPSPISALFSGVLLPAATYVVYMVYQV-------NPLTNIFVIFTTLSIITASIILTYQWHIKRMFAY 277
229584692 205 PMYTWLPDAHSEAPSPISALFSGVLLPAATYVVYMVYQV-------NPLTNIFVIFTTLSIITASIILTYQWHIKRMFAY 277
227830170 205 PMYTWLPDAHSEAPSPISALFSGVLLPAATYVVYMVYQV-------NPLTNIFVIFTTLSIITASIILTYQWHIKRMFAY 277
229578985 205 PMYTWLPDAHSEAPSPISALFSGVLLPAATYVVYMVYQV-------NPLTNIFVIFTTLSIITASIILTYQWHIKRMFAY 277
13542286  207 PVHTWLPDAHSEAPSPVSAMFSGVLLPTALYVLYRVYEI-------EPVRGLYVWFAVVSIVAASIFMGYQARYKRMFAY 279
48477899  208 PMHSWLPDAHSEAPAPTSAMFSGVLLPVALYVVYRIYEI-------DRLRMLFIIFSITSMGFAAIFLSYQTRYKRMFAY 280
260845118 317 SSVENMGLVAVALGIGGPLGIFAALLHTLNHSLAKTLLFCGSGNVLLKYGTRDLNVVCGMLKIMPFTAVLFGGGalalal 396
229582262 278 STIENMNLALLGLTIGQPLG---AIILLLAHAFGKAGAFYSSGIVLKVLGEKRIENIGGLHTKLKLTSVSLLLS------ 348
284997589 278 STIENMNLALLGLTIGQPLG---AIILLLAHAFGKAGAFYSSGIVLKVLGEKRIENIGGLHTKLKLTSVSLLLS------ 348
238619634 278 STIENMNLALLGLTIGQPLG---AIILLLAHAFGKAGAFYSSGIVLKVLGEKRIENIGGLHTKLKLTSVSLLLS------ 348
227827478 278 STIENMNLALLGLTIGQPLG---AIILLLAHAFGKAGAFYSSGIVLKVLGEKRIENIGGLHTKLKLTSVSLLLS------ 348
229584692 278 STIENMNLALLGLTIGQPLG---AIILLLAHAFGKAGAFYSSGIVLKVLGEKRIENIGGLHTKLKLTSVSLLLS------ 348
227830170 278 STIENMNLALLGLTIGQPLG---AIILLLAHAFGKAGAFYSSGIVLKVLGEKRIENIGGLHTKLKLTSVSLLLS------ 348
229578985 278 STIENMNLALLGLTIGQPLG---AIILLLAHAFGKAGAFYSSGIVLKVLGEKRIENIGGLHTKLKLTSVSLLLS------ 348
13542286  280 STMENMNLALLGIAVGGSLGFTGALLLLLSHSFGKAGAFYSSGNILRFTGKKEIAEINGMHTSMPYTSTSLLMS------ 353
48477899  281 STMENMSMALLGIALGG-YAFLGAIILLLAHSFGKAGAFFSSGNILYYSDKKSVFDINSIYKNNKVLGISLLLS------ 353
260845118 397 alALALAGMPPFNIFLSEFMTITAGLARNHLLiIVLLLLLLTLVLAGLVRMAARVLMAKPPQAVNRGdlgwlTTSPMVIL 476
229582262 349 --SLTVTGTPPFATFIGEFFILQTLIQKDYIIeFILIVISLATAFISINYNVTKMIFTQR--ELTVSeepklITFISLVS 424
284997589 349 --SLAVTGTPPFATFIGEFFILQTLIQKGYIIeFILIVISLATAFISINYNVTKMIFTQR--ELTVSeepklITFISLVS 424
238619634 349 --SLAVTGTPPFATFIGEFFILQTLIQKGYIIeFILIVISLATAFISINYNVTKMIFTQR--ELTVSeepklITFISLVS 424
227827478 349 --SLAVTGTPPFATFIGEFFILQTLIQKGYIIeFILIVISLATAFISINYNVTKMIFTQR--ELTVSeepklITFISLVS 424
229584692 349 --SLAVTGTPPFATFIGEFFILQTLIQKGYIIeFILIVISLATAFISINYNVTKMIFTQR--ELTVSeepklITFISLVS 424
227830170 349 --SLAVTGTPPFATFIGEFFILQTLIQKGYIIeFILIVISLATAFISINYNVTKMIFTQR--ELTVSeepklITFISLVS 424
229578985 349 --SLAVTGTPPFATFIGEFFILQTLIQKGYIIeFILIVISLATAFISINYNVTKMIFTQR--ELTVSeepklITFISLVS 424
13542286  354 --SLAVTGAPPFGTFFGEFLILSGVLSLHMYVqFIIVIVFLAAAFISMNYNVTGMIFNGNCPNIEKDrlmpaLS---IFS 428
48477899  354 --SLAVTGTPPFGTFIGEFLIIYGIFKSGLWYlAIPVIIFIFMAFVSINMNVTGMMLGDENHDIKIPkimlyTS---LIM 428
260845118 477 LVMMLAMGTHIPQPVIRIL 495
229582262 425 SIIPLVLGILLLVILS--- 440
284997589 425 SIIPLVLGILLLVILS--- 440
238619634 425 SIIPLVLGILLLVILL--- 440
227827478 425 SIIPLVLGILLLVILL--- 440
229584692 425 SIIPLVLGILLLVILL--- 440
227830170 425 SIIPLVLGILLLVILS--- 440
229578985 425 SIIPLVLGILLLVILS--- 440
13542286  429 SVIPLFIGIFFLVVYNEIL 447
48477899  429 PVISLIIGLYLVVYHEIL- 446
| Disclaimer | Privacy statement | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap