Conserved Protein Domain Family
PRK08583

?
PRK08583: PRK08583 
RNA polymerase sigma factor SigB; Validated
Statistics
?
PSSM-Id: 236306
Aligned: 62 rows
Threshold Bit Score: 414.092
Created: 9-Dec-2010
Updated: 25-Oct-2021
Structure
?
Aligned Rows:
Sequence Alignment
?
Format: Row Display: Color Bits: Type Selection:
229917800   1 MPAKSQQRHHSDDEVLEWIERYQQDDqNEEVQMLLINRYSDLVEALARKFSRGRAIHDDLVQVGMIGLLAALRRFDPEFG 80 
296501716   1 MEIQSQPTNLTKEDVIKLIADFQQNQ-CDEAQERLVEHYKNLVYSIAYRYSKGGPMHEDIIQVGMLGLLGAIRRYDYSIG 79 
163938900   1 MEIQSQPTDLTKEDVIKLIAEFQQNQ-CDEAQERLVNHYKNLVYSIAYRYSKGGPMHEDIIQVGMLGLLGAIRRYDYSIG 79 
42780162    1 MEIQSQPTTLTKEDVMKLIAEFQQNQ-CDEAQERLVEHYKNLVYSIAYRYSKGGPMHEDIIQVGMLGLLGAIRRYDYSIG 79 
30019159    2 MEIQSQPTNLTKEDVIKLIADFQQNQ-CDEAQERLVEHYKNLVYSIAYRYSKGGPMHEDIIQVGMLGLLGAIRRYDYSIG 80 
52144331    2 MEIQSQPTNLTKEDVIKLIAEFQQNQ-CGEAQERLVDHYKNLVYSIAYRYSKGGPMHEDIIQVGMLGLLGAIRRYDYSIG 80 
222094730   1 MEIQSQPTTLTKEDVMKLIAEFQQNQ-CDEAQERLVEHYKNLVYSIAYRYSKGGPMHEDIIQVGMLGLLGAIRRYDYSIG 79 
218232670   1 MEIQSQPTNLTKEDVIKLIADFQQNQ-CDEAQERLVNHYKNLVYSIAYRYSKGGPMHEDIIQVGMLGLLGAIRRYDYSIG 79 
217958581   1 MEIQSQPTTLTKEDVIKLIAEFQQNQ-CDEAQERLVEHYKNLVYSIAYRYSKGGPMHEDIIQVGMLGLLGAIRRYDYSIG 79 
225862940   1 MEIQSQPTNLTKEDVIKLIAEFQQNQ-CGEAQERLVNHYKNLVYSIAYRYSKGGPMHEDIIQVGMLGLLGAIRRYDYSIG 79 
229917800  81 RSFESFAVPTIIGEIKRFIRDKTWSVHVPRRIKELGPKIKKTVEELTTELQRSPRIDEIADHLGVSDEEILETLEMGKSY 160
296501716  80 NAFEPFAIPTIVGEIKKYLRDKTWGIHVPRRIKDLGGKIKLAIEELTDHLQRSPKIIEIANHLGLSEEEVLEIMDAKNNY 159
163938900  80 NAFEPFAIPTIVGEIKKYLRDKTWGVHVPRRIKDLGGKIKLAIEELTDHLQRSPKIIEIANHLGLSEEEVLEIMDAKNNY 159
42780162   80 NAFEPFAIPTIVGEIKKYLRDKTWGIHVPRRIKDLGGKIKLAIEELTDQLQRSPKIIEIADHLELSEEEVLEIMDAKNNY 159
30019159   81 NAFEPFAIPTIVGEIKKYLRDKTWGIHVPRRIKDLGGKIKLAIEELTDHLQRSPRIIEIANHLGLSEEEVLEIMDAKNNY 160
52144331   81 NAFEPFAIPTIVGEIKKYLRDKTWGIHVPRRIKDLGGKIKLAIEELTDHLQRSPKIIEIADHLGLSEEEVLEIMDAKNNY 160
222094730  80 NAFEPFAIPTIVGEIKKYLRDKTWGIHVPRRIKDLGGKIKLAIEELTDRLQRSPKIIEIADHLGLSEEEVLEIMDAKNNY 159
218232670  80 NAFEPFAIPTIVGEIKKYLRDKTWGIHVPRRIKDLGGKIKLAIEELTDRFQRSPKIIEIADHLGLSEEEVLEIMDAKNNY 159
217958581  80 NAFEPFAIPTIVGEIKKYLRDKTWGIHVPRRIKDLGGKIKLAIEELTDRLQRSPKIIEIADHLGLSEEEVLEIMDAKNNY 159
225862940  80 NAFEPFAIPTIVGEIKKYLRDKTWGIHVPRRIKDLGGKIKLAIEELTDHLQRSPKIIEIADHLGLSEEEVLEIMDAKNNY 159
229917800 161 QALSVDSSIEADNEGSTVTLLDLVGSQERGYESVDQRLILEKAFNVLNERERAILECAYYKNMSQKETGELLGISQMHVS 240
296501716 160 RVSSLDDVVENSSDGSSVARIESVGEVEQGYEETERRLVLKDIFNVLNDTEKSVIHYIFGENLNQKDTGERLGISQMHVS 239
163938900 160 QVSSLDDVVENSSDGSSVARIESVGEVEQGYEQTERRLVLDDIFNVLNDTEKSVIHYIFGENLNQKDTGERLGISQMHVS 239
42780162  160 RVSSLDDVVENASDGSSVARIESVGEVEQGYEETERRLVLKDIFNVLNETEKSVIHYIFEENLNQKDTGERLGISQMHVS 239
30019159  161 RVSSLDDVVENSSDGSSVARIESVGEVEQGYEETERRLVLKDIFNVLNDTEKSVIHYIFGENLNQKDTGERLGISQMHVS 240
52144331  161 RVSSLDDVVENASDGSSVARIESVGEVEQGYEQTERRLVLEDIFNVLNETEKSVIHYIFEENLNQKDTGERLGISQMHVS 240
222094730 160 RVSSLDDVVENASDGSSVARIESVGEVEQGYEETERRLVLKDIFNVLNDTEKSVIHYIFGENLNQKDTGERLGISQMHVS 239
218232670 160 RVSSLDDVVENSSDGSSVARIESVGEVEQGYEETERRLVLKDIFNVLNDTEKSVIHYIFGENLNQKDTGERLGISQMHVS 239
217958581 160 RVSSLDDVVENASDGSSVARIESVGEVEQGYEETERRLVLKDIFNVLNDTEKSVIHYIFGENLNQKDTGERLGISQMHVS 239
225862940 160 RVSSLDDVVENASDGSSVARIESVGEVEQGYEETERRLVLKDIFNVLNETEKSVIHYIFEENLNQKDTGERLGISQMHVS 239
229917800 241 RLQRRALEKLREAIKV 256
296501716 240 RIKRQAISKLKQAAFL 255
163938900 240 RIKRQAISKLKQAAFL 255
42780162  240 RIKRQAISKLKQAAFL 255
30019159  241 RIKRQAISKLKQAAFL 256
52144331  241 RIKRQAISKLKQAAFL 256
222094730 240 RIKRQAISKLKQAAFL 255
218232670 240 RIKRQAISKLKQAAFL 255
217958581 240 RIKRQAISKLKQAAFL 255
225862940 240 RIKRQAISKLKQAAFL 255
| Disclaimer | Privacy statement | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap