Conserved Protein Domain Family
PLN00120

?
PLN00120: PLN00120 
fucoxanthin-chlorophyll a-c binding protein; Provisional
Statistics
?
PSSM-Id: 215063
Aligned: 20 rows
Threshold Bit Score: 308.981
Created: 9-Dec-2010
Updated: 25-Oct-2021
Structure
?
Aligned Rows:
Sequence Alignment
?
Format: Row Display: Color Bits: Type Selection:
224000930  48 RKSVIFAATIAAASAFAPAQvAKTTTSLN---AFEDELGAQAPLGFFDPFGMLSgDCTQERFDRLRYVEIKHGRIAQLAF 124
219123828   1 MKTAVLASLIATAAAFAPAQ-KAVTSTALsasNFEDALGAQPPLGFYDPLGLLD-GASESKFERLRYVELKHGRISMLAV 78 
219126950   1 MKLALFATFVAGAAAFAAKKgAKKRAAVVt-gNFEEDIGATLPLGFWDPLGLVA-DGNQEKFDRLRLVELKHGRISMLAV 78 
223998112   2 YKSLLIASSIAAASAFAPVQvAKTTTSLN---AFESEIGAQAPLGFWDPLGFLD-RADQETFDRLRYVELKHGRIAQLAF 77 
219128691   2 MKLALLASIAAGAAAFAPSQgQSARASVAtnmAFENEAGVTAPLGFYDPLGLVS-DGDEAKFKRLRFVELKHGRISMLAV 80 
223993505   1 MKSVIFAATIAAASAFAPAQvAKTTTSLN---AFEDELGAQAPLGFFDPFGMLSgDCTQERFDRLRYVEIKHGRIAQLAF 77 
224012725   2 FKSVLIAASLASASAFAPAQvAKSTTALN---AFENELGVQAPLGFFDPLGLLD-NADQERFDRLRYVELKHGRIAQLAF 77 
224012385   2 FKSVLIAASLASAAAFQSASpVAKTTALN---AFENELGVQPPIGFFDPLGLLD-GADQERFDRLRYVEIKHGRIAQLAF 77 
224012180   1 -KSVIFAAAIASAAAFAPAQvGKTSTAIN---AFENELGAQAPLGFFDPLGMLD-DADQERFDRLRYVELKHGRISQLAF 75 
224011910   2 YKSLLIASSIAAASAFAPAPvAKSTTAIN---AFENELGAQPPLGFFDPLGMLD-EAGQARFDRLRYVELKHGRICQLAF 77 
224000930 125 LGQVVTRAGIHLPGSINYAGDSFDSFPNGVAalfGPNSIPTAGLVQIISFIGILECAFMRDVPGTGnEHVGDFRNGYIDF 204
219123828  79 VGYLVTEAGIRLPGNIDYSGTKFTDIPGGFD---ALSAISKEGLGQIIGFIFFLEM-IMRPIGGRG-EFVGDFRNDAIDF 153
219126950  79 VGYLIQEAGVRLPGNIDLSGTKFSDIPNGYA---AIEAIPYAGKLQLLAFIGALEVFVMRDFVG-G-EFPGDLRNNYIDF 153
223998112  78 VGNLITRAGYHLPGDISL-GRAFADVPNGIAainGPDAISTAALLQTLAFIGFLETRVMIDATGES-QFRGDFRNGF-DF 154
219128691  81 VGYIATATGNRLPGTIDFAGTKFSDIPAGFG---SLANIPAAGLCQILFFIGLLETSFMRDWVG-G-ESVGDFRNKYIDF 155
223993505  78 LGQVVTRAGIHLPGSINYAGDSFDSFPNGVAalfGPNSIPTAGLVQIISFIGILECAFMRDVPGTGnEHVGDFRNGYIDF 157
224012725  78 LGNIITRAGVHLPGNIDYAGNSFDSFPNGWAainGPDAITGTGLGQIVAFVGFLELFVMKDITG-G-EFVGDFRNGFIDF 155
224012385  78 LGNIITRAGVHLPGNIDYAGNSFDSFPNGWAainGPDAITGTGLGQIVAFIGFLELFVMKDIEGTGnEFVGDFRNGAIDF 157
224012180  76 LGQIVTRNGIRLPGDIDYSGTSFSDIGEGWA---GSLQVPVAGALQILAFVGFLELAVMKDVTGEG-EFVGDFRNGALDF 151
224011910  78 LGNIITRAGIHLPGAISLDGTKFSDIGNGWA---GSFEVPKDGALQILFFVGFLELFVMKDVTGEG-EFVGDFRNGALDF 153
224000930 205 GWDEFDEETKLSKRAIELNNGRAAMMGILGLMVHEEIiplgyDAdlPIIGH 255
219123828 154 GWDTFDEETKLKKRAIELNQGRAAQMGILALMVHEQL-----GV--PIIPS 197
219126950 154 GWDSFDDATKARKRTIELNQGRAAQMGILALMVHEQL-----GV--SIIPS 197
223998112 155 GWDKQSPEWQTNKRAIELNQGRAAMMGILGLMMHEQV-----GGtfPIVGE 200
219128691 156 GWDSFSDEEKARQYNVELNQGRAAQMGILALMVHEQL-----GNvdDILPF 201
223993505 158 GWDEFDEETKLSKRAIELNNGRAAMMGILGLMVHEEIiplgyDAdlPIIGH 208
224012725 156 GWDTFSEEKKMQKRAIELNNGRAAMMGILGLMMHEQI-----GGvfPITGE 201
224012385 158 GWDTFSDEVKLQKRAIELNNGRAAMMGILGLMMHEQL-----GGsiPIVGE 203
224012180 152 GWDSFDEETKLSKRAIELNNGRAAMMGILGLMVHEQL-----GGelPIVGQ 197
224011910 154 GWDSFSEETKLQKRAIELNNGRAAMMGILGLMVHEQL-----GGelPIVGQ 199
| Disclaimer | Privacy statement | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap