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dbSNP Short Genetic Variations

Welcome to the Reference SNP (rs) Report

All alleles are reported in the Forward orientation. Click on the Variant Details tab for details on Genomic Placement, Gene, and Amino Acid changes. HGVS names are in the HGVS tab.

Reference SNP (rs) Report

This page reports data for a single dbSNP Reference SNP variation (RefSNP or rs) from the new redesigned dbSNP build.
Top of the page reports a concise summary for the rs, with more specific details included in the corresponding tabs below.
All alleles are reported in the Forward orientation. Use the Genomic View to inspect the nucleotides flanking the variant, and its neighbors.
For more information see Help documentation.

rs201036709

Current Build 156

Released September 21, 2022

Organism
Homo sapiens
Position
chr11:94093972-94094014 (GRCh38.p14) Help

The anchor position for this RefSNP. Includes all nucleotides potentially affected by this change, thus it can differ from HGVS, which is right-shifted. See here for details.

Alleles
del(TA)17 / del(TA)16 / del(TA)15

del(TA)17 / del(TA)16 / del(TA)15 / del(TA)14 / del(TA)13 / del(TA)12 / del(TA)11 / del(TA)10 / del(TA)9 / del(TA)8 / del(TA)7 / del(TA)6 / del(TA)5 / del(TA)4 / del(TA)3 / delTATA / delTA / dupTA / dupTATA / dup(TA)3 / dup(TA)4 / dup(TA)5 / dup(TA)6 / dup(TA)7 / dup(TA)8 / dup(TA)9 / dup(TA)10 / dup(TA)11 / dup(TA)12 / dup(TA)13 / dup(TA)14 / dup(TA)15 / dup(TA)16

Variation Type
Indel Insertion and Deletion
Frequency
del(TA)17=0.0000 (0/5250, ALFA)
del(TA)16=0.0000 (0/5250, ALFA)
del(TA)15=0.0000 (0/5250, ALFA) (+ 23 more)
del(TA)14=0.0000 (0/5250, ALFA)
del(TA)13=0.0000 (0/5250, ALFA)
del(TA)12=0.0000 (0/5250, ALFA)
del(TA)11=0.0000 (0/5250, ALFA)
del(TA)10=0.0000 (0/5250, ALFA)
del(TA)9=0.0000 (0/5250, ALFA)
del(TA)8=0.0000 (0/5250, ALFA)
del(TA)7=0.0000 (0/5250, ALFA)
del(TA)6=0.0000 (0/5250, ALFA)
del(TA)5=0.0000 (0/5250, ALFA)
del(TA)4=0.0000 (0/5250, ALFA)
del(TA)3=0.0000 (0/5250, ALFA)
delTATA=0.0000 (0/5250, ALFA)
delTA=0.0000 (0/5250, ALFA)
dupTA=0.0000 (0/5250, ALFA)
dupTATA=0.0000 (0/5250, ALFA)
dup(TA)3=0.0000 (0/5250, ALFA)
dup(TA)4=0.0000 (0/5250, ALFA)
dup(TA)5=0.0000 (0/5250, ALFA)
dup(TA)6=0.0000 (0/5250, ALFA)
dup(TA)7=0.0000 (0/5250, ALFA)
dup(TA)8=0.0000 (0/5250, ALFA)
dup(TA)10=0.0000 (0/5250, ALFA)
Clinical Significance
Not Reported in ClinVar
Gene : Consequence
HEPHL1 : Intron Variant
Publications
0 citations
Genomic View
See rs on genome

ALFA Allele Frequency
The ALFA project provide aggregate allele frequency from dbGaP. More information is available on the project page including descriptions, data access, and terms of use.

Release Version: 20231103111315
Population Group Sample Size Ref Allele Alt Allele Ref HMOZ Alt HMOZ HTRZ HWEP
Total Global 5250 ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=1.0000 ATATATATA=0.0000, ATATATATATA=0.0000, ATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000 1.0 0.0 0.0 N/A
European Sub 3708 ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=1.0000 ATATATATA=0.0000, ATATATATATA=0.0000, ATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0000 1.0 0.0 0.0 N/A
African Sub 948 ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=1.000 ATATATATA=0.000, ATATATATATA=0.000, ATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000 1.0 0.0 0.0 N/A
African Others Sub 30 ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=1.00 ATATATATA=0.00, ATATATATATA=0.00, ATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00 1.0 0.0 0.0 N/A
African American Sub 918 ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=1.000 ATATATATA=0.000, ATATATATATA=0.000, ATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000 1.0 0.0 0.0 N/A
Asian Sub 34 ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=1.00 ATATATATA=0.00, ATATATATATA=0.00, ATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00 1.0 0.0 0.0 N/A
East Asian Sub 30 ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=1.00 ATATATATA=0.00, ATATATATATA=0.00, ATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00 1.0 0.0 0.0 N/A
Other Asian Sub 4 ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=1.0 ATATATATA=0.0, ATATATATATA=0.0, ATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.0 1.0 0.0 0.0 N/A
Latin American 1 Sub 62 ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=1.00 ATATATATA=0.00, ATATATATATA=0.00, ATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00 1.0 0.0 0.0 N/A
Latin American 2 Sub 286 ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=1.000 ATATATATA=0.000, ATATATATATA=0.000, ATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000 1.0 0.0 0.0 N/A
South Asian Sub 36 ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=1.00 ATATATATA=0.00, ATATATATATA=0.00, ATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.00 1.0 0.0 0.0 N/A
Other Sub 176 ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=1.000 ATATATATA=0.000, ATATATATATA=0.000, ATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000, ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA=0.000 1.0 0.0 0.0 N/A


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Frequency tab displays a table of the reference and alternate allele frequencies reported by various studies and populations. Table lines, where Population="Global" refer to the entire study population, whereas lines, where Group="Sub", refer to a study-specific population subgroupings (i.e. AFR, CAU, etc.), if available. Frequency for the alternate allele (Alt Allele) is a ratio of samples observed-to-total, where the numerator (observed samples) is the number of chromosomes in the study with the minor allele present (found in "Sample size", where Group="Sub"), and the denominator (total samples) is the total number of all chromosomes in the study for the variant (found in "Sample size", where Group="Study-wide" and Population="Global").

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Study Population Group Sample Size Ref Allele Alt Allele
Allele Frequency Aggregator Total Global 5250 (AT)21A=1.0000 del(TA)17=0.0000, del(TA)16=0.0000, del(TA)15=0.0000, del(TA)14=0.0000, del(TA)13=0.0000, del(TA)12=0.0000, del(TA)11=0.0000, del(TA)10=0.0000, del(TA)9=0.0000, del(TA)8=0.0000, del(TA)7=0.0000, del(TA)6=0.0000, del(TA)5=0.0000, del(TA)4=0.0000, del(TA)3=0.0000, delTATA=0.0000, delTA=0.0000, dupTA=0.0000, dupTATA=0.0000, dup(TA)3=0.0000, dup(TA)4=0.0000, dup(TA)5=0.0000, dup(TA)6=0.0000, dup(TA)7=0.0000, dup(TA)8=0.0000, dup(TA)10=0.0000
Allele Frequency Aggregator European Sub 3708 (AT)21A=1.0000 del(TA)17=0.0000, del(TA)16=0.0000, del(TA)15=0.0000, del(TA)14=0.0000, del(TA)13=0.0000, del(TA)12=0.0000, del(TA)11=0.0000, del(TA)10=0.0000, del(TA)9=0.0000, del(TA)8=0.0000, del(TA)7=0.0000, del(TA)6=0.0000, del(TA)5=0.0000, del(TA)4=0.0000, del(TA)3=0.0000, delTATA=0.0000, delTA=0.0000, dupTA=0.0000, dupTATA=0.0000, dup(TA)3=0.0000, dup(TA)4=0.0000, dup(TA)5=0.0000, dup(TA)6=0.0000, dup(TA)7=0.0000, dup(TA)8=0.0000, dup(TA)10=0.0000
Allele Frequency Aggregator African Sub 948 (AT)21A=1.000 del(TA)17=0.000, del(TA)16=0.000, del(TA)15=0.000, del(TA)14=0.000, del(TA)13=0.000, del(TA)12=0.000, del(TA)11=0.000, del(TA)10=0.000, del(TA)9=0.000, del(TA)8=0.000, del(TA)7=0.000, del(TA)6=0.000, del(TA)5=0.000, del(TA)4=0.000, del(TA)3=0.000, delTATA=0.000, delTA=0.000, dupTA=0.000, dupTATA=0.000, dup(TA)3=0.000, dup(TA)4=0.000, dup(TA)5=0.000, dup(TA)6=0.000, dup(TA)7=0.000, dup(TA)8=0.000, dup(TA)10=0.000
Allele Frequency Aggregator Latin American 2 Sub 286 (AT)21A=1.000 del(TA)17=0.000, del(TA)16=0.000, del(TA)15=0.000, del(TA)14=0.000, del(TA)13=0.000, del(TA)12=0.000, del(TA)11=0.000, del(TA)10=0.000, del(TA)9=0.000, del(TA)8=0.000, del(TA)7=0.000, del(TA)6=0.000, del(TA)5=0.000, del(TA)4=0.000, del(TA)3=0.000, delTATA=0.000, delTA=0.000, dupTA=0.000, dupTATA=0.000, dup(TA)3=0.000, dup(TA)4=0.000, dup(TA)5=0.000, dup(TA)6=0.000, dup(TA)7=0.000, dup(TA)8=0.000, dup(TA)10=0.000
Allele Frequency Aggregator Other Sub 176 (AT)21A=1.000 del(TA)17=0.000, del(TA)16=0.000, del(TA)15=0.000, del(TA)14=0.000, del(TA)13=0.000, del(TA)12=0.000, del(TA)11=0.000, del(TA)10=0.000, del(TA)9=0.000, del(TA)8=0.000, del(TA)7=0.000, del(TA)6=0.000, del(TA)5=0.000, del(TA)4=0.000, del(TA)3=0.000, delTATA=0.000, delTA=0.000, dupTA=0.000, dupTATA=0.000, dup(TA)3=0.000, dup(TA)4=0.000, dup(TA)5=0.000, dup(TA)6=0.000, dup(TA)7=0.000, dup(TA)8=0.000, dup(TA)10=0.000
Allele Frequency Aggregator Latin American 1 Sub 62 (AT)21A=1.00 del(TA)17=0.00, del(TA)16=0.00, del(TA)15=0.00, del(TA)14=0.00, del(TA)13=0.00, del(TA)12=0.00, del(TA)11=0.00, del(TA)10=0.00, del(TA)9=0.00, del(TA)8=0.00, del(TA)7=0.00, del(TA)6=0.00, del(TA)5=0.00, del(TA)4=0.00, del(TA)3=0.00, delTATA=0.00, delTA=0.00, dupTA=0.00, dupTATA=0.00, dup(TA)3=0.00, dup(TA)4=0.00, dup(TA)5=0.00, dup(TA)6=0.00, dup(TA)7=0.00, dup(TA)8=0.00, dup(TA)10=0.00
Allele Frequency Aggregator South Asian Sub 36 (AT)21A=1.00 del(TA)17=0.00, del(TA)16=0.00, del(TA)15=0.00, del(TA)14=0.00, del(TA)13=0.00, del(TA)12=0.00, del(TA)11=0.00, del(TA)10=0.00, del(TA)9=0.00, del(TA)8=0.00, del(TA)7=0.00, del(TA)6=0.00, del(TA)5=0.00, del(TA)4=0.00, del(TA)3=0.00, delTATA=0.00, delTA=0.00, dupTA=0.00, dupTATA=0.00, dup(TA)3=0.00, dup(TA)4=0.00, dup(TA)5=0.00, dup(TA)6=0.00, dup(TA)7=0.00, dup(TA)8=0.00, dup(TA)10=0.00
Allele Frequency Aggregator Asian Sub 34 (AT)21A=1.00 del(TA)17=0.00, del(TA)16=0.00, del(TA)15=0.00, del(TA)14=0.00, del(TA)13=0.00, del(TA)12=0.00, del(TA)11=0.00, del(TA)10=0.00, del(TA)9=0.00, del(TA)8=0.00, del(TA)7=0.00, del(TA)6=0.00, del(TA)5=0.00, del(TA)4=0.00, del(TA)3=0.00, delTATA=0.00, delTA=0.00, dupTA=0.00, dupTATA=0.00, dup(TA)3=0.00, dup(TA)4=0.00, dup(TA)5=0.00, dup(TA)6=0.00, dup(TA)7=0.00, dup(TA)8=0.00, dup(TA)10=0.00
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Variant Details tab shows known variant placements on genomic sequences: chromosomes (NC_), RefSeqGene, pseudogenes or genomic regions (NG_), and in a separate table: on transcripts (NM_) and protein sequences (NP_). The corresponding transcript and protein locations are listed in adjacent lines, along with molecular consequences from Sequence Ontology. When no protein placement is available, only the transcript is listed. Column "Codon[Amino acid]" shows the actual base change in the format of "Reference > Alternate" allele, including the nucleotide codon change in transcripts, and the amino acid change in proteins, respectively, allowing for known ribosomal slippage sites. To view nucleotides adjacent to the variant use the Genomic View at the bottom of the page - zoom into the sequence until the nucleotides around the variant become visible.

Genomic Placements
Sequence name Change
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[4]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[5]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[6]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[7]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[8]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[9]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[10]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[11]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[12]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[13]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[14]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[15]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[16]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[17]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[18]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[19]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[20]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[22]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[23]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[24]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[25]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[26]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[27]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[28]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[29]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[30]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[31]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[32]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[33]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[34]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[35]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[36]
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093973TA[37]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[4]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[5]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[6]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[7]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[8]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[9]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[10]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[11]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[12]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[13]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[14]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[15]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[16]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[17]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[18]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[19]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[20]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[22]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[23]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[24]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[25]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[26]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[27]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[28]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[29]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[30]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[31]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[32]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[33]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[34]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[35]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[36]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827139TA[37]
Gene: HEPHL1, hephaestin like 1 (plus strand)
Molecule type Change Amino acid[Codon] SO Term
HEPHL1 transcript NM_001098672.2:c.2434+332…

NM_001098672.2:c.2434+332AT[4]

N/A Intron Variant
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Clinical Significance tab shows a list of clinical significance entries from ClinVar associated with the variation, per allele. Click on the RCV accession (i.e. RCV000001615.2) or Allele ID (i.e. 12274) to access full ClinVar report.

Not Reported in ClinVar
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Aliases tab displays HGVS names representing the variant placements and allele changes on genomic, transcript and protein sequences, per allele. HGVS name is an expression for reporting sequence accession and version, sequence type, position, and allele change. The column "Note" can have two values: "diff" means that there is a difference between the reference allele (variation interval) at the placement reported in HGVS name and the reference alleles reported in other HGVS names, and "rev" means that the sequence of this variation interval at the placement reported in HGVS name is in reverse orientation to the sequence(s) of this variation in other HGVS names not labeled as "rev".

Placement (AT)21A= del(TA)17 del(TA)16 del(TA)15 del(TA)14 del(TA)13 del(TA)12 del(TA)11 del(TA)10 del(TA)9 del(TA)8 del(TA)7 del(TA)6 del(TA)5 del(TA)4 del(TA)3 delTATA delTA dupTA dupTATA dup(TA)3 dup(TA)4 dup(TA)5 dup(TA)6 dup(TA)7 dup(TA)8 dup(TA)9 dup(TA)10 dup(TA)11 dup(TA)12 dup(TA)13 dup(TA)14 dup(TA)15 dup(TA)16
GRCh38.p14 chr 11 NC_000011.10:g.94093972_94094014= NC_000011.10:g.94093973TA[4] NC_000011.10:g.94093973TA[5] NC_000011.10:g.94093973TA[6] NC_000011.10:g.94093973TA[7] NC_000011.10:g.94093973TA[8] NC_000011.10:g.94093973TA[9] NC_000011.10:g.94093973TA[10] NC_000011.10:g.94093973TA[11] NC_000011.10:g.94093973TA[12] NC_000011.10:g.94093973TA[13] NC_000011.10:g.94093973TA[14] NC_000011.10:g.94093973TA[15] NC_000011.10:g.94093973TA[16] NC_000011.10:g.94093973TA[17] NC_000011.10:g.94093973TA[18] NC_000011.10:g.94093973TA[19] NC_000011.10:g.94093973TA[20] NC_000011.10:g.94093973TA[22] NC_000011.10:g.94093973TA[23] NC_000011.10:g.94093973TA[24] NC_000011.10:g.94093973TA[25] NC_000011.10:g.94093973TA[26] NC_000011.10:g.94093973TA[27] NC_000011.10:g.94093973TA[28] NC_000011.10:g.94093973TA[29] NC_000011.10:g.94093973TA[30] NC_000011.10:g.94093973TA[31] NC_000011.10:g.94093973TA[32] NC_000011.10:g.94093973TA[33] NC_000011.10:g.94093973TA[34] NC_000011.10:g.94093973TA[35] NC_000011.10:g.94093973TA[36] NC_000011.10:g.94093973TA[37]
GRCh37.p13 chr 11 NC_000011.9:g.93827138_93827180= NC_000011.9:g.93827139TA[4] NC_000011.9:g.93827139TA[5] NC_000011.9:g.93827139TA[6] NC_000011.9:g.93827139TA[7] NC_000011.9:g.93827139TA[8] NC_000011.9:g.93827139TA[9] NC_000011.9:g.93827139TA[10] NC_000011.9:g.93827139TA[11] NC_000011.9:g.93827139TA[12] NC_000011.9:g.93827139TA[13] NC_000011.9:g.93827139TA[14] NC_000011.9:g.93827139TA[15] NC_000011.9:g.93827139TA[16] NC_000011.9:g.93827139TA[17] NC_000011.9:g.93827139TA[18] NC_000011.9:g.93827139TA[19] NC_000011.9:g.93827139TA[20] NC_000011.9:g.93827139TA[22] NC_000011.9:g.93827139TA[23] NC_000011.9:g.93827139TA[24] NC_000011.9:g.93827139TA[25] NC_000011.9:g.93827139TA[26] NC_000011.9:g.93827139TA[27] NC_000011.9:g.93827139TA[28] NC_000011.9:g.93827139TA[29] NC_000011.9:g.93827139TA[30] NC_000011.9:g.93827139TA[31] NC_000011.9:g.93827139TA[32] NC_000011.9:g.93827139TA[33] NC_000011.9:g.93827139TA[34] NC_000011.9:g.93827139TA[35] NC_000011.9:g.93827139TA[36] NC_000011.9:g.93827139TA[37]
HEPHL1 transcript NM_001098672.1:c.2434+332= NM_001098672.1:c.2434+332AT[4] NM_001098672.1:c.2434+332AT[5] NM_001098672.1:c.2434+332AT[6] NM_001098672.1:c.2434+332AT[7] NM_001098672.1:c.2434+332AT[8] NM_001098672.1:c.2434+332AT[9] NM_001098672.1:c.2434+332AT[10] NM_001098672.1:c.2434+332AT[11] NM_001098672.1:c.2434+332AT[12] NM_001098672.1:c.2434+332AT[13] NM_001098672.1:c.2434+332AT[14] NM_001098672.1:c.2434+332AT[15] NM_001098672.1:c.2434+332AT[16] NM_001098672.1:c.2434+332AT[17] NM_001098672.1:c.2434+332AT[18] NM_001098672.1:c.2434+332AT[19] NM_001098672.1:c.2434+332AT[20] NM_001098672.1:c.2434+332AT[22] NM_001098672.1:c.2434+332AT[23] NM_001098672.1:c.2434+332AT[24] NM_001098672.1:c.2434+332AT[25] NM_001098672.1:c.2434+332AT[26] NM_001098672.1:c.2434+332AT[27] NM_001098672.1:c.2434+332AT[28] NM_001098672.1:c.2434+332AT[29] NM_001098672.1:c.2434+332AT[30] NM_001098672.1:c.2434+332AT[31] NM_001098672.1:c.2434+332AT[32] NM_001098672.1:c.2434+332AT[33] NM_001098672.1:c.2434+332AT[34] NM_001098672.1:c.2434+332AT[35] NM_001098672.1:c.2434+332AT[36] NM_001098672.1:c.2434+332AT[37]
HEPHL1 transcript NM_001098672.2:c.2434+332= NM_001098672.2:c.2434+332AT[4] NM_001098672.2:c.2434+332AT[5] NM_001098672.2:c.2434+332AT[6] NM_001098672.2:c.2434+332AT[7] NM_001098672.2:c.2434+332AT[8] NM_001098672.2:c.2434+332AT[9] NM_001098672.2:c.2434+332AT[10] NM_001098672.2:c.2434+332AT[11] NM_001098672.2:c.2434+332AT[12] NM_001098672.2:c.2434+332AT[13] NM_001098672.2:c.2434+332AT[14] NM_001098672.2:c.2434+332AT[15] NM_001098672.2:c.2434+332AT[16] NM_001098672.2:c.2434+332AT[17] NM_001098672.2:c.2434+332AT[18] NM_001098672.2:c.2434+332AT[19] NM_001098672.2:c.2434+332AT[20] NM_001098672.2:c.2434+332AT[22] NM_001098672.2:c.2434+332AT[23] NM_001098672.2:c.2434+332AT[24] NM_001098672.2:c.2434+332AT[25] NM_001098672.2:c.2434+332AT[26] NM_001098672.2:c.2434+332AT[27] NM_001098672.2:c.2434+332AT[28] NM_001098672.2:c.2434+332AT[29] NM_001098672.2:c.2434+332AT[30] NM_001098672.2:c.2434+332AT[31] NM_001098672.2:c.2434+332AT[32] NM_001098672.2:c.2434+332AT[33] NM_001098672.2:c.2434+332AT[34] NM_001098672.2:c.2434+332AT[35] NM_001098672.2:c.2434+332AT[36] NM_001098672.2:c.2434+332AT[37]
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Submissions tab displays variations originally submitted to dbSNP, now supporting this RefSNP cluster (rs). We display Submitter handle, Submission identifier, Date and Build number, when the submission appeared for the first time. Direct submissions to dbSNP have Submission ID in the form of an ss-prefixed number (ss#). Other supporting variations are listed in the table without ss#.

68 SubSNP, 48 Frequency submissions
No Submitter Submission ID Date (Build)
1 HGSV ss81500807 Aug 21, 2014 (142)
2 GMI ss289088446 May 04, 2012 (137)
3 SSMP ss664079546 Apr 01, 2015 (144)
4 EVA_GENOME_DK ss1574398243 Apr 01, 2015 (144)
5 EVA_GENOME_DK ss1583563905 Apr 01, 2015 (144)
6 KCHEN_CANCERGENOMICS ss2632415454 Oct 12, 2018 (152)
7 MCHAISSO ss3064528693 Nov 08, 2017 (151)
8 MCHAISSO ss3065442989 Nov 08, 2017 (151)
9 ACPOP ss3738429385 Jul 13, 2019 (153)
10 ACPOP ss3738429386 Jul 13, 2019 (153)
11 ACPOP ss3738429387 Jul 13, 2019 (153)
12 ACPOP ss3738429388 Jul 13, 2019 (153)
13 ACPOP ss3738429389 Jul 13, 2019 (153)
14 ACPOP ss3738429390 Jul 13, 2019 (153)
15 PACBIO ss3787030701 Jul 13, 2019 (153)
16 PACBIO ss3792159751 Jul 13, 2019 (153)
17 PACBIO ss3792159752 Jul 13, 2019 (153)
18 PACBIO ss3797042169 Jul 13, 2019 (153)
19 PACBIO ss3797042170 Jul 13, 2019 (153)
20 KHV_HUMAN_GENOMES ss3814990625 Jul 13, 2019 (153)
21 EVA ss3832772557 Apr 26, 2020 (154)
22 GNOMAD ss4240327949 Apr 26, 2021 (155)
23 GNOMAD ss4240327994 Apr 26, 2021 (155)
24 GNOMAD ss4240327996 Apr 26, 2021 (155)
25 GNOMAD ss4240327997 Apr 26, 2021 (155)
26 GNOMAD ss4240327998 Apr 26, 2021 (155)
27 GNOMAD ss4240327999 Apr 26, 2021 (155)
28 GNOMAD ss4240328000 Apr 26, 2021 (155)
29 GNOMAD ss4240328001 Apr 26, 2021 (155)
30 GNOMAD ss4240328002 Apr 26, 2021 (155)
31 GNOMAD ss4240328003 Apr 26, 2021 (155)
32 GNOMAD ss4240328004 Apr 26, 2021 (155)
33 GNOMAD ss4240328005 Apr 26, 2021 (155)
34 GNOMAD ss4240328006 Apr 26, 2021 (155)
35 GNOMAD ss4240328007 Apr 26, 2021 (155)
36 GNOMAD ss4240328008 Apr 26, 2021 (155)
37 GNOMAD ss4240328009 Apr 26, 2021 (155)
38 GNOMAD ss4240328016 Apr 26, 2021 (155)
39 GNOMAD ss4240328017 Apr 26, 2021 (155)
40 GNOMAD ss4240328018 Apr 26, 2021 (155)
41 GNOMAD ss4240328019 Apr 26, 2021 (155)
42 GNOMAD ss4240328020 Apr 26, 2021 (155)
43 GNOMAD ss4240328021 Apr 26, 2021 (155)
44 GNOMAD ss4240328022 Apr 26, 2021 (155)
45 GNOMAD ss4240328023 Apr 26, 2021 (155)
46 GNOMAD ss4240328024 Apr 26, 2021 (155)
47 GNOMAD ss4240328025 Apr 26, 2021 (155)
48 GNOMAD ss4240328026 Apr 26, 2021 (155)
49 GNOMAD ss4240328027 Apr 26, 2021 (155)
50 GNOMAD ss4240328028 Apr 26, 2021 (155)
51 GNOMAD ss4240328029 Apr 26, 2021 (155)
52 GNOMAD ss4240328030 Apr 26, 2021 (155)
53 GNOMAD ss4240328031 Apr 26, 2021 (155)
54 GNOMAD ss4240328032 Apr 26, 2021 (155)
55 HUGCELL_USP ss5483503839 Oct 16, 2022 (156)
56 HUGCELL_USP ss5483503840 Oct 16, 2022 (156)
57 HUGCELL_USP ss5483503841 Oct 16, 2022 (156)
58 HUGCELL_USP ss5483503842 Oct 16, 2022 (156)
59 HUGCELL_USP ss5483503843 Oct 16, 2022 (156)
60 HUGCELL_USP ss5483503844 Oct 16, 2022 (156)
61 TOMMO_GENOMICS ss5751630074 Oct 16, 2022 (156)
62 TOMMO_GENOMICS ss5751630075 Oct 16, 2022 (156)
63 TOMMO_GENOMICS ss5751630076 Oct 16, 2022 (156)
64 TOMMO_GENOMICS ss5751630077 Oct 16, 2022 (156)
65 TOMMO_GENOMICS ss5751630078 Oct 16, 2022 (156)
66 TOMMO_GENOMICS ss5751630079 Oct 16, 2022 (156)
67 EVA ss5837056123 Oct 16, 2022 (156)
68 EVA ss5837056124 Oct 16, 2022 (156)
69 The Danish reference pan genome

Submission ignored due to conflicting rows:
Row 19267 (NC_000011.9:93827139:ATATATATATATATATATATAT: 40/40)
Row 313012 (NC_000011.9:93827137:ATATATATATATATATATATATAT: 36/40)

- Apr 26, 2020 (154)
70 The Danish reference pan genome

Submission ignored due to conflicting rows:
Row 19267 (NC_000011.9:93827139:ATATATATATATATATATATAT: 40/40)
Row 313012 (NC_000011.9:93827137:ATATATATATATATATATATATAT: 36/40)

- Apr 26, 2020 (154)
71 gnomAD - Genomes

Submission ignored due to conflicting rows:
Row 388363388 (NC_000011.10:94093971::AT 1201/67378)
Row 388363433 (NC_000011.10:94093971::ATAT 1889/67088)
Row 388363435 (NC_000011.10:94093971::ATATAT 1281/67254)...

- Apr 26, 2021 (155)
72 gnomAD - Genomes

Submission ignored due to conflicting rows:
Row 388363388 (NC_000011.10:94093971::AT 1201/67378)
Row 388363433 (NC_000011.10:94093971::ATAT 1889/67088)
Row 388363435 (NC_000011.10:94093971::ATATAT 1281/67254)...

- Apr 26, 2021 (155)
73 gnomAD - Genomes

Submission ignored due to conflicting rows:
Row 388363388 (NC_000011.10:94093971::AT 1201/67378)
Row 388363433 (NC_000011.10:94093971::ATAT 1889/67088)
Row 388363435 (NC_000011.10:94093971::ATATAT 1281/67254)...

- Apr 26, 2021 (155)
74 gnomAD - Genomes

Submission ignored due to conflicting rows:
Row 388363388 (NC_000011.10:94093971::AT 1201/67378)
Row 388363433 (NC_000011.10:94093971::ATAT 1889/67088)
Row 388363435 (NC_000011.10:94093971::ATATAT 1281/67254)...

- Apr 26, 2021 (155)
75 gnomAD - Genomes

Submission ignored due to conflicting rows:
Row 388363388 (NC_000011.10:94093971::AT 1201/67378)
Row 388363433 (NC_000011.10:94093971::ATAT 1889/67088)
Row 388363435 (NC_000011.10:94093971::ATATAT 1281/67254)...

- Apr 26, 2021 (155)
76 gnomAD - Genomes

Submission ignored due to conflicting rows:
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- Apr 26, 2021 (155)
77 gnomAD - Genomes

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- Apr 26, 2021 (155)
78 gnomAD - Genomes

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79 gnomAD - Genomes

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- Apr 26, 2021 (155)
80 gnomAD - Genomes

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- Apr 26, 2021 (155)
81 gnomAD - Genomes

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89 gnomAD - Genomes

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90 gnomAD - Genomes

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- Apr 26, 2021 (155)
95 gnomAD - Genomes

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97 gnomAD - Genomes

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99 gnomAD - Genomes

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- Apr 26, 2021 (155)
100 gnomAD - Genomes

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- Apr 26, 2021 (155)
101 gnomAD - Genomes

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- Apr 26, 2021 (155)
102 gnomAD - Genomes

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- Apr 26, 2021 (155)
103 gnomAD - Genomes

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- Apr 26, 2021 (155)
104 Northern Sweden

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- Jul 13, 2019 (153)
105 Northern Sweden

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- Jul 13, 2019 (153)
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- Jul 13, 2019 (153)
107 Northern Sweden

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- Jul 13, 2019 (153)
108 Northern Sweden

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- Jul 13, 2019 (153)
109 Northern Sweden

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- Jul 13, 2019 (153)
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- Oct 16, 2022 (156)
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- Oct 16, 2022 (156)
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- Oct 16, 2022 (156)
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- Oct 16, 2022 (156)
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Row 85467178 (NC_000011.10:94093971:ATATAT: 4803/28156)
Row 85467179 (NC_000011.10:94093971::AT 1909/28156)
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- Oct 16, 2022 (156)
116 ALFA NC_000011.10 - 94093972 Apr 26, 2021 (155)
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History tab displays RefSNPs (Associated ID) from previous builds (Build) that now support the current RefSNP, and the dates, when the history was updated for each Associated ID (History Updated).

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Submission IDs Observation SPDI Canonical SPDI Source RSIDs
ss4240328032 NC_000011.10:94093971:ATATATATATAT…

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NC_000011.10:94093971:ATATATATATAT…

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(self)
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NC_000011.10:94093971:ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA:ATATATATA

NC_000011.10:94093971:ATATATATATAT…

NC_000011.10:94093971:ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA:ATATATATA

(self)
ss4240328031 NC_000011.10:94093971:ATATATATATAT…

NC_000011.10:94093971:ATATATATATATATATATATATATATATATAT:

NC_000011.10:94093971:ATATATATATAT…

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(self)
93449079 NC_000011.10:94093971:ATATATATATAT…

NC_000011.10:94093971:ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA:ATATATATATA

NC_000011.10:94093971:ATATATATATAT…

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Help

Publications tab displays PubMed articles citing the variation as a listing of PMID, Title, Author, Year, Journal, ordered by Year, descending.

No publications for rs201036709

Help

The Flanks tab provides retrieving flanking sequences of a SNP on all molecules that have placements.

Genome context:
Select flank length:

Genomic regions, transcripts, and products
Top Help

NCBI Graphical Sequence Viewer display of the genomic region, transcripts and protein products for the reported RefSNP (rs).
Use the zoom option to view the nucleotides around the RefSNP and find other neighboring RefSNPs.
Visit Sequence Viewer for help with navigating inside the display and modifying the selection of displayed data tracks.

Software version is: 2.0.1.post820+afb47a3d