|
|
GEO help: Mouse over screen elements for information. |
|
Status |
Public on Apr 01, 2018 |
Title |
Bernard Lab PAM50 qRT-PCR assay |
Technology type |
RT-PCR |
Distribution |
non-commercial |
Organism |
Homo sapiens |
Manufacturer |
Bernard Lab, Huntsman Cancer Institute |
Manufacture protocol |
n/a
|
|
|
Description |
PAM50 qRT-PCR assay
|
|
|
Submission date |
Mar 20, 2018 |
Last update date |
Apr 01, 2018 |
Contact name |
Nicola J Camp |
E-mail(s) |
[email protected]
|
Organization name |
University of Utah
|
Department |
Huntsman Cancer Institute
|
Lab |
Camp
|
Street address |
2000 Cir of Hope Dr
|
City |
Salt Lake City |
State/province |
UT |
ZIP/Postal code |
84103 |
Country |
USA |
|
|
Samples (246)
|
GSM3056628, GSM3056629, GSM3056630, GSM3056631, GSM3056632, GSM3056633
GSM3056634, GSM3056635, GSM3056636, GSM3056637, GSM3056638, GSM3056639, GSM3056640, GSM3056641, GSM3056642, GSM3056643, GSM3056644, GSM3056645, GSM3056646, GSM3056647, GSM3056648, GSM3056649, GSM3056650, GSM3056651, GSM3056652, GSM3056653, GSM3056654, GSM3056655, GSM3056656, GSM3056657, GSM3056658, GSM3056659, GSM3056660, GSM3056661, GSM3056662, GSM3056663, GSM3056664, GSM3056665, GSM3056666, GSM3056667, GSM3056668, GSM3056669, GSM3056670, GSM3056671, GSM3056672, GSM3056673, GSM3056674, GSM3056675, GSM3056676, GSM3056677, GSM3056678, GSM3056679, GSM3056680, GSM3056681, GSM3056682, GSM3056683, GSM3056684, GSM3056685, GSM3056686, GSM3056687, GSM3056688, GSM3056689, GSM3056690, GSM3056691, GSM3056692, GSM3056693, GSM3056694, GSM3056695, GSM3056696, GSM3056697, GSM3056698, GSM3056699, GSM3056700, GSM3056701, GSM3056702, GSM3056703, GSM3056704, GSM3056705, GSM3056706, GSM3056707, GSM3056708, GSM3056709, GSM3056710, GSM3056711, GSM3056712, GSM3056713, GSM3056714, GSM3056715, GSM3056716, GSM3056717, GSM3056718, GSM3056719, GSM3056720, GSM3056721, GSM3056722, GSM3056723, GSM3056724, GSM3056725, GSM3056726, GSM3056727, GSM3056728, GSM3056729, GSM3056730, GSM3056731, GSM3056732, GSM3056733, GSM3056734, GSM3056735, GSM3056736, GSM3056737, GSM3056738, GSM3056739, GSM3056740, GSM3056741, GSM3056742, GSM3056743, GSM3056744, GSM3056745, GSM3056746, GSM3056747, GSM3056748, GSM3056749, GSM3056750, GSM3056751, GSM3056752, GSM3056753, GSM3056754, GSM3056755, GSM3056756, GSM3056757, GSM3056758, GSM3056759, GSM3056760, GSM3056761, GSM3056762, GSM3056763, GSM3056764, GSM3056765, GSM3056766, GSM3056767, GSM3056768, GSM3056769, GSM3056771, GSM3056772, GSM3056773, GSM3056774, GSM3056776, GSM3056778, GSM3056779, GSM3056781, GSM3056783, GSM3056784, GSM3056786, GSM3056788, GSM3056789, GSM3056791, GSM3056793, GSM3056794, GSM3056796, GSM3056798, GSM3056800, GSM3056801, GSM3056803, GSM3056805, GSM3056807, GSM3056808, GSM3056810, GSM3056812, GSM3056815, GSM3056817, GSM3056818, GSM3056820, GSM3056822, GSM3056824, GSM3056825, GSM3056827, GSM3056829, GSM3056831, GSM3056833, GSM3056835, GSM3056837, GSM3056839, GSM3056841, GSM3056843, GSM3056845, GSM3056847, GSM3056848, GSM3056851, GSM3056852, GSM3056854, GSM3056856, GSM3056858, GSM3056860, GSM3056861, GSM3056862, GSM3056863, GSM3056864, GSM3056865, GSM3056866, GSM3056867, GSM3056868, GSM3056869, GSM3056870, GSM3056871, GSM3056872, GSM3056873, GSM3056874, GSM3056875, GSM3056876, GSM3056877, GSM3056878, GSM3056879, GSM3056880, GSM3056881, GSM3056882, GSM3056883, GSM3056884, GSM3056885, GSM3056886, GSM3056887, GSM3056888, GSM3056889, GSM3056890, GSM3056891, GSM3056892, GSM3056893, GSM3056894, GSM3056895, GSM3056896, GSM3056897, GSM3056898, GSM3056899, GSM3056900, GSM3056901, GSM3056902, GSM3056903, GSM3056904, GSM3056905, GSM3056906, GSM3056907, GSM3056908, GSM3056909, GSM3056910, GSM3056911, GSM3056912, GSM3056913
|
Series (1) |
GSE112063 |
Quantitative reverse transcription PCR analysis of human breast tumor cells in the PAM50 genes |
|
Data table header descriptions |
ID |
|
ORF |
Gene symbol |
ENSEMBL_ID |
|
GENE_NAME |
|
GENE_CLASS |
|
Data table |
ID |
ORF |
ENSEMBL_ID |
GENE_NAME |
GENE_CLASS |
ACTB |
ACTB |
ENSG00000075624 |
actin beta |
housekeeping |
ACTR3B |
ACTR3B |
ENSG00000133627 |
ARP3 actin related protein 3 homolog B |
target |
ANLN |
ANLN |
ENSG00000011426 |
anillin actin binding protein |
target |
BAG1 |
BAG1 |
ENSG00000107262 |
BCL2 associated athanogene 1 |
target |
BCL2 |
BCL2 |
ENSG00000171791 |
BCL2, apoptosis regulator |
target |
BIRC5 |
BIRC5 |
ENSG00000089685 |
baculoviral IAP repeat containing 5 |
target |
BLVRA |
BLVRA |
ENSG00000106605 |
biliverdin reductase A |
target |
CCNB1 |
CCNB1 |
ENSG00000134057 |
cyclin B1 |
target |
CCNE1 |
CCNE1 |
ENSG00000105173 |
cyclin E1 |
target |
CDC20 |
CDC20 |
ENSG00000117399 |
cell division cycle 20 |
target |
CDC6 |
CDC6 |
ENSG00000094804 |
cell division cycle 6 |
target |
CDCA1 |
CDCA1 |
ENSG00000143228 |
NUF2, NDC80 kinetochore complex component |
target |
CDH3 |
CDH3 |
ENSG00000062038 |
cadherin 3 |
target |
CENPF |
CENPF |
ENSG00000117724 |
centromere protein F |
target |
CEP55 |
CEP55 |
ENSG00000138180 |
centrosomal protein 55 |
target |
CXXC5 |
CXXC5 |
ENSG00000171604 |
CXXC finger protein 5 |
target |
EGFR |
EGFR |
ENSG00000146648 |
epidermal growth factor receptor |
target |
ERBB2 |
ERBB2 |
ENSG00000141736 |
erb-b2 receptor tyrosine kinase 2 |
target |
ESR1 |
ESR1 |
ENSG00000091831 |
estrogen receptor 1 |
target |
EXO1 |
EXO1 |
ENSG00000174371 |
exonuclease 1 |
target |
Total number of rows: 55
Table truncated, full table size 3 Kbytes.
Supplementary data files not provided |
|
|
|
|
|