GEO help: Mouse over screen elements for information.
Status
Public on May 08, 2018
Title
[Clariom_S_Human_HT] Affymetrix Clariom S Assay HT, Human (Includes Pico Assay)
Technology type
in situ oligonucleotide
Distribution
commercial
Organism
Homo sapiens
Manufacturer
Affymetrix
Manufacture protocol
See manufacturers website
Description
This platform supports submissions for: Clariom S Assay HT:https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/902969 Clariom S Pico Assay HT:https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/902964 Annotations: #%lib_set_version=r1 #%genome-species=Homo sapiens #%genome-version=hg38 #%genome-version-ucsc=hg38 #%genome-version-ncbi=GRCh38 #%genome-version-create_date=2013-12-00 #%genome-lifted-method=psl-map.pl #%genome-lifted_from-species=Homo sapiens #%genome-lifted_from-version-ucsc=hg38 #%genome-lifted_from-version-ncbi=GRCh38 #%netaffx-annotation-date=2016-06-03 #%netaffx-annotation-netaffx-build=36
Submission date
Nov 30, 2017
Last update date
Jan 31, 2019
Organization
Affymetrix, Inc.
E-mail(s)
[email protected] , [email protected]
Phone
888-362-2447
URL
http://www.affymetrix.com/index.affx
Street address
City
Santa Clara
State/province
CA
ZIP/Postal code
95051
Country
USA
Samples (1459)
GSM2637891 , GSM2637892 , GSM2637893 , GSM2637894 , GSM2637895 , GSM2637896
GSM2637897 ,
GSM2637898 ,
GSM2637899 ,
GSM2637900 ,
GSM2637901 ,
GSM2637902 ,
GSM2637903 ,
GSM2637904 ,
GSM2637905 ,
GSM2637906 ,
GSM2870703 ,
GSM2870704 ,
GSM2870705 ,
GSM2870706 ,
GSM2870707 ,
GSM2870708 ,
GSM2870709 ,
GSM2870710 ,
GSM2870711 ,
GSM2870712 ,
GSM2870713 ,
GSM2870714 ,
GSM2870715 ,
GSM2870716 ,
GSM2870717 ,
GSM2870718 ,
GSM2870719 ,
GSM2870720 ,
GSM2870721 ,
GSM2870722 ,
GSM2870723 ,
GSM2870724 ,
GSM2870725 ,
GSM2870726 ,
GSM2870727 ,
GSM2870728 ,
GSM2870729 ,
GSM2870730 ,
GSM2870731 ,
GSM2870732 ,
GSM2870733 ,
GSM2870734 ,
GSM2870735 ,
GSM2870736 ,
GSM2870737 ,
GSM2870738 ,
GSM2870739 ,
GSM2870740 ,
GSM2870741 ,
GSM2870742 ,
GSM2870743 ,
GSM2870744 ,
GSM2870745 ,
GSM2870746 ,
GSM2870747 ,
GSM2870748 ,
GSM2870749 ,
GSM2870750 ,
GSM2870751 ,
GSM2870752 ,
GSM2870753 ,
GSM2870754 ,
GSM2870755 ,
GSM2870756 ,
GSM2870757 ,
GSM2870758 ,
GSM2870759 ,
GSM2870760 ,
GSM2870761 ,
GSM2870762 ,
GSM2870763 ,
GSM2870764 ,
GSM2870765 ,
GSM2870766 ,
GSM2870767 ,
GSM2870768 ,
GSM2870769 ,
GSM2870770 ,
GSM2870771 ,
GSM2870772 ,
GSM2870773 ,
GSM2870774 ,
GSM2870775 ,
GSM2870776 ,
GSM2870777 ,
GSM2870778 ,
GSM2870779 ,
GSM2870780 ,
GSM2870781 ,
GSM2870782 ,
GSM2870783 ,
GSM2870784 ,
GSM2870785 ,
GSM2870786 ,
GSM2870787 ,
GSM2870788 ,
GSM2870789 ,
GSM2870790 ,
GSM2870791 ,
GSM2870792 ,
GSM2870793 ,
GSM2870794 ,
GSM2870795 ,
GSM2870796 ,
GSM2870797 ,
GSM2870798 ,
GSM2870799 ,
GSM2870800 ,
GSM2870801 ,
GSM2870802 ,
GSM2870803 ,
GSM2870804 ,
GSM2870805 ,
GSM3110484 ,
GSM3110485 ,
GSM3110486 ,
GSM3110487 ,
GSM3110488 ,
GSM3110489 ,
GSM3110490 ,
GSM3110491 ,
GSM3110492 ,
GSM3110493 ,
GSM3110494 ,
GSM3110495 ,
GSM3110496 ,
GSM3110497 ,
GSM3110498 ,
GSM3110499 ,
GSM3110500 ,
GSM3110501 ,
GSM3110502 ,
GSM3110503 ,
GSM3110504 ,
GSM3110505 ,
GSM3110506 ,
GSM3110507 ,
GSM3110508 ,
GSM3110509 ,
GSM3110510 ,
GSM3110511 ,
GSM3110512 ,
GSM3110513 ,
GSM3110514 ,
GSM3110515 ,
GSM3110516 ,
GSM3137779 ,
GSM3137780 ,
GSM3137781 ,
GSM3137782 ,
GSM3137783 ,
GSM3137784 ,
GSM3302044 ,
GSM3302045 ,
GSM3302046 ,
GSM3302047 ,
GSM3302048 ,
GSM3302049 ,
GSM3302050 ,
GSM3302051 ,
GSM3302052 ,
GSM3302053 ,
GSM3484078 ,
GSM3484079 ,
GSM3484080 ,
GSM3484081 ,
GSM3484082 ,
GSM3484083 ,
GSM3484084 ,
GSM3484085 ,
GSM3484086 ,
GSM3484087 ,
GSM3484088 ,
GSM3484089 ,
GSM3484090 ,
GSM3484091 ,
GSM3484092 ,
GSM3484093 ,
GSM3484094 ,
GSM3484095 ,
GSM3484096 ,
GSM3484097 ,
GSM3484098 ,
GSM3484099 ,
GSM3484100 ,
GSM3484101 ,
GSM3484102 ,
GSM3484103 ,
GSM3484104 ,
GSM3484105 ,
GSM3484106 ,
GSM3484107 ,
GSM3484108 ,
GSM3484109 ,
GSM3484110 ,
GSM3484111 ,
GSM3484112 ,
GSM3484113 ,
GSM3484114 ,
GSM3484115 ,
GSM3484116 ,
GSM3484117 ,
GSM3484118 ,
GSM3484119 ,
GSM3484120 ,
GSM3484121 ,
GSM3484122 ,
GSM3484123 ,
GSM3484124 ,
GSM3484125 ,
GSM3484126 ,
GSM3484127 ,
GSM3484128 ,
GSM3484129 ,
GSM3484130 ,
GSM3484131 ,
GSM3484132 ,
GSM3484133 ,
GSM3484134 ,
GSM3484135 ,
GSM3484136 ,
GSM3484137 ,
GSM3484138 ,
GSM3484139 ,
GSM3484140 ,
GSM3484141 ,
GSM3484142 ,
GSM3484143 ,
GSM3484144 ,
GSM3484145 ,
GSM3484146 ,
GSM3484147 ,
GSM3484148 ,
GSM3484149 ,
GSM3484150 ,
GSM3484151 ,
GSM3484152 ,
GSM3484153 ,
GSM3484154 ,
GSM3484155 ,
GSM3484156 ,
GSM3484157 ,
GSM3484158 ,
GSM3484159 ,
GSM3484160 ,
GSM3484161 ,
GSM3484162 ,
GSM3484163 ,
GSM3484164 ,
GSM3484165 ,
GSM3484166 ,
GSM3484167 ,
GSM3484168 ,
GSM3484169 ,
GSM3484170 ,
GSM3484171 ,
GSM3484172 ,
GSM3484173 ,
GSM3484174 ,
GSM3484175 ,
GSM3484176 ,
GSM3484177 ,
GSM3484178 ,
GSM3484179 ,
GSM3484180 ,
GSM3484181 ,
GSM3484182 ,
GSM3484183 ,
GSM3484184 ,
GSM3484185 ,
GSM3484186 ,
GSM3484187 ,
GSM3484188 ,
GSM3484189 ,
GSM3484190 ,
GSM3484191 ,
GSM3484192 ,
GSM3484193 ,
GSM3484194 ,
GSM3484195 ,
GSM3484196 ,
GSM3484197 ,
GSM3484198 ,
GSM3484199 ,
GSM3484200 ,
GSM3484201 ,
GSM3484202 ,
GSM3484203 ,
GSM3484204 ,
GSM3484205 ,
GSM3484206 ,
GSM3484207 ,
GSM3484208 ,
GSM3484209 ,
GSM3484210 ,
GSM3484211 ,
GSM3484212 ,
GSM3484213 ,
GSM3484214 ,
GSM3484215 ,
GSM3484216 ,
GSM3484217 ,
GSM3484218 ,
GSM3509929 ,
GSM3509930 ,
GSM3509931 ,
GSM3509932 ,
GSM3509933 ,
GSM3509934 ,
GSM3509935 ,
GSM3509936 ,
GSM3509937 ,
GSM3509938 ,
GSM3509939 ,
GSM3509940 ,
GSM3509941 ,
GSM3509942 ,
GSM3511834 ,
GSM3511835 ,
GSM3511836 ,
GSM3511837 ,
GSM3511838 ,
GSM3511839 ,
GSM3511840 ,
GSM3511841 ,
GSM3511842 ,
GSM3511843 ,
GSM3511844 ,
GSM3511845 ,
GSM3511846 ,
GSM3511847 ,
GSM3511848 ,
GSM3511849 ,
GSM3511850 ,
GSM3511851 ,
GSM3511852 ,
GSM3511853 ,
GSM3511854 ,
GSM3511855 ,
GSM3511856 ,
GSM3511857 ,
GSM3557819 ,
GSM3557820 ,
GSM3557821 ,
GSM3557822 ,
GSM3557823 ,
GSM3557824 ,
GSM3557825 ,
GSM3557826 ,
GSM3557827 ,
GSM3557828 ,
GSM3557829 ,
GSM3557830 ,
GSM3557831 ,
GSM3557832 ,
GSM3557833 ,
GSM3557834 ,
GSM3580430 ,
GSM3580431 ,
GSM3580432 ,
GSM3580433 ,
GSM3580434 ,
GSM3580435 ,
GSM3580436 ,
GSM3580437 ,
GSM3580438 ,
GSM3580439 ,
GSM3580440 ,
GSM3580441 ,
GSM3580442 ,
GSM3580443 ,
GSM3580444 ,
GSM3580445 ,
GSM3580446 ,
GSM3580447 ,
GSM3580448 ,
GSM3580449 ,
GSM3580450 ,
GSM3580451 ,
GSM3580452 ,
GSM3580453 ,
GSM3602012 ,
GSM3602013 ,
GSM3602014 ,
GSM3602015 ,
GSM3602016 ,
GSM3602017 ,
GSM3602018 ,
GSM3602019 ,
GSM3602020 ,
GSM3602021 ,
GSM3602022 ,
GSM3602023 ,
GSM3602024 ,
GSM3602025 ,
GSM3602026 ,
GSM3602027 ,
GSM3602028 ,
GSM3602029 ,
GSM3602030 ,
GSM3602031 ,
GSM3602032 ,
GSM3602033 ,
GSM3602034 ,
GSM3602035 ,
GSM3602036 ,
GSM3602037 ,
GSM3616181 ,
GSM3616182 ,
GSM3616183 ,
GSM3616184 ,
GSM3616185 ,
GSM3616186 ,
GSM3616187 ,
GSM3616188 ,
GSM3616189 ,
GSM3616190 ,
GSM3616191 ,
GSM3616192 ,
GSM3616193 ,
GSM3616194 ,
GSM3616195 ,
GSM3616196 ,
GSM3616197 ,
GSM3616198 ,
GSM3616199 ,
GSM3616200 ,
GSM3616201 ,
GSM3616202 ,
GSM3616203 ,
GSM3616204 ,
GSM3616205 ,
GSM3616206 ,
GSM3616207 ,
GSM3616208 ,
GSM3616209 ,
GSM3616210 ,
GSM3616211 ,
GSM3616212 ,
GSM3616213 ,
GSM3616214 ,
GSM3616215 ,
GSM3616216 ,
GSM3616217 ,
GSM3616218 ,
GSM3616219 ,
GSM3616220 ,
GSM3616221 ,
GSM3616222 ,
GSM3616223 ,
GSM3616224 ,
GSM3616225 ,
GSM3616226 ,
GSM3616227 ,
GSM3616228 ,
GSM3703318 ,
GSM3703319 ,
GSM3703320 ,
GSM3703321 ,
GSM3703322 ,
GSM3703323 ,
GSM3703324 ,
GSM3703325 ,
GSM3703326 ,
GSM3703327 ,
GSM3703328 ,
GSM3703329 ,
GSM3703330 ,
GSM3703331 ,
GSM3703332 ,
GSM3703333 ,
GSM3703334 ,
GSM3703335 ,
GSM3716832 ,
GSM3716833 ,
GSM3716834 ,
GSM3716835 ,
GSM3716836 ,
GSM3716837 ,
GSM3716838 ,
GSM3716839 ,
GSM3716840 ,
GSM3716841 ,
GSM3716842 ,
GSM3716843 ,
GSM3716844 ,
GSM3716845 ,
GSM3716846 ,
GSM3716847 ,
GSM3716848 ,
GSM3716849 ,
GSM3716850 ,
GSM3716851 ,
GSM3716852 ...
Accession list truncated, click here to browse through all related public accessions You can also download a list of all accessions here
Series (48)
GSE99236
Transcriptional changes induced in human CD4+ cells upon ectopic expression of FOXP3
GSE107537
The effect of simulated night shift work on the circadian regulation of the human transcriptome
GSE113630
Gene expression data from bioprinted liver tissues treated with 0.1% DMSO (dimethyl sulfoxide: vehicle), 10 ng/mL transforming growth factor beta 1 (TGF-β1) or 0.209 µM methotrexate (MTX) for either 14 or 28 days.
GSE114203
A microarray analysis of human epidermal keratinocytes upon depletion of the long non-coding RNA LOC100130476
GSE117506
A global transcriptome analysis of human epidermal keratinocytes upon overexpression of microRNA-34a or microRNA-34c
GSE122725
The phase-shifting effect of bright light exposure on circadian rhythmicity in the human transcriptome
GSE123709
ROLE OF EXOSOMAL miRNAs IN METASTATIC POST-TRANSPLANT COLORECTAL CARCINOMA UNDER RAPAMYCIN AND CYCLOSPORINE (Clariom_S_Human)
GSE123710
ROLE OF EXOSOMAL miRNAs IN METASTATIC POST-TRANSPLANT COLORECTAL CARCINOMA UNDER RAPAMYCIN AND CYCLOSPORINE
GSE123817
KLRG1 and NKp46 discriminate subpopulations of human CD117+ CRTH2- ILCs biased toward ILC2 or ILC3
GSE124878
Peritoneal macrophage heterogeneity in decompensated liver cirrhosis
GSE125690
Gene expression data from THP-1 cells exposed to exosomes from acetaminophen-treated or vehicle-treated hepatocytes or corresponding mock- or medium-controls
GSE126453
Effect of Omomyc treatment on human lung adenocarcinoma cell lines
GSE126455
Effect of Omomyc treatment on lung adenocarcinoma of KRasLSL-G12D/+ transgenic mouse and human lung adenocarcinoma cell lines
GSE126881
Identification of Radiosensitivity Gene Signatures Induced by Enzalutamide in Prostate cancer cells
GSE129238
Differential c-Kit expression identifies two subsets of ILC2s with IL-17 producing capabilities that may contribute to IL-17 mediated pathologies
GSE129604
Acute Effects of Single Doses of Bonito Fish Peptides and Vitamin D on Whole Blood Gene Expression Levels
GSE136059
Gene expression data from primary human hepatocytes treated with idelalisib for 24 h
GSE136758
Anti-inflammatory properties of low dose epirubicin on human macrophages
GSE145334
Transcriptional analysis of naïve and central memory CD4 and CD8 T cells from healthy subjects treated with IL-27
GSE147231
Identification of human cytotoxic ILC3s
GSE147484
The effects on oncogenic pathway, signaling, by RSK2 N-terminal kinase inhibitor (BI-D1870) in Mantle cell lymphoma-derived cell lines.
GSE148233
Macrophages in Crohn’s disease creeping fat are predominantly inflammatory and produce calprotectin
GSE148682
Combination therapies induce cancer cell death through the integrated stress response and disturbed pyrimidine metabolism
GSE155747
Ant-leukemic effect of CDK9 inhibition in T-cell prolymphocytic leukemia (mRNA)
GSE163224
Gene Expression Data from Influenza A Virus-Infected and Mock-infected A549 Human Aveolar Epithelial Carcinoma Cells with Exposure to Mouse Eosinophils.
GSE174447
Effect of Omomyc treatment on human TNBC MDAMB231 cell line
GSE181822
Clustering of Surrogates of Cardiovascular Risk Factors Results in Emergent Phenotypes in Endothelial Cells
GSE188725
Time-regulated transcripts with the potential to modulate human pluripotent stem cell-derived cardiomyocyte differentiation [gene]
GSE188749
Time-regulated transcripts with the potential to modulate human pluripotent stem cell-derived cardiomyocyte differentiation
GSE195577
AC-265347 inhibits neuroblastoma tumor growth by induction of differentiation without causing hypocalcemia
GSE200748
Gene expression data from parental HeLa and Dickkopf-1 (Dkk1) knockout HeLa cells after Cisplatin treatment
GSE201555
Transcriptional analysis of primary astrocytes from human fœtal brain inflamed or not with IL-1 beta and subsequently exposed to IL-27
GSE202514
Recurrent triple-negative breast cancer from cysteine deprivation loses tumorigenicity via downregulation of the CST4 signaling
GSE203149
Gene expression data from muscle-invasive bladder cancer samples
GSE206103
Human skin specific long noncoding RNA HOXC13-AS regulates keratinocyte differentiation by inferfering with Golgi-ER retrograde transport
GSE220899
Genome-wide DNA methylation and mRNA responses to a bout of higher versus lower load resistance training in previously trained men
GSE224188
Effects of miR-4707-3p expression on differentiation of primary human neural progenitor cells
GSE227840
Effect of Omomyc on the in vitro growth of A375 human melanoma cell line
GSE227841
Effect of Omomyc on the in vivo growth of melanomas
GSE227842
Effect of Omomyc on the in vivo growth of melanomas [SkMel147]
GSE228172
Gene Expression Profiling Unveils the Temporal Dynamics of CIGB-300-Regulated Transcriptome in AML Cells
GSE241027
Gene expression data from CD8+ T cell subsets
GSE245862
STAT3 phosphorylation at serine 727 activates specific genetic programs and promotes clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) aggressiveness
GSE247523
Pro-inflammatory T cells-derived cytokines enhance the maturation of the human fetal intestinal barrier
GSE255674
Gene expression profiling of human colorectal cancer cell lines [Affymetrix]
GSE262610
Gene expression data from a xenograft derived from the bladder cancer cell line HT1367
GSE273850
Expression data from human trisomy 21 and euploid fibroblasts, iPSCs, and neural progenitor cells
GSE278710
A feedforward loop between STAT1 and YAP1 stimulates lipid biosynthesis, accelerates tumor growth, and promotes chemotherapy resistance in mutant KRAS colorectal cancer.
Relations
Alternative to
GPL25336 (alternative CDF [clariomshumanhthsentrezgprobe_22.0.0])
Alternative to
GPL25361 (alternative)
Data table header descriptions
ID
Affymetrix transcript cluster id
probeset_id
seqname
strand
start
stop
total_probes
category
SPOT_ID
locus type & mrna_assignment
SPOT_ID
Data table
ID
probeset_id
seqname
strand
start
stop
total_probes
category
SPOT_ID
SPOT_ID
TC0100006437.hg.1
TC0100006437.hg.1
chr1
+
69091
70008
10
main
Coding
NM_001005484 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 5 (OR4F5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000335137 // ENSEMBL // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 5 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003223 // Havana transcript // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 5[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aal.1 // UCSC Genes // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 5 (OR4F5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS30547.1 // ccdsGene // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 5 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:14825] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
TC0100006476.hg.1
TC0100006476.hg.1
chr1
+
924880
944581
10
main
Multiple_Complex
NM_152486 // RefSeq // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 (SAMD11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000341065 // ENSEMBL // sterile alpha motif domain containing 11 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000342066 // ENSEMBL // sterile alpha motif domain containing 11 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000420190 // ENSEMBL // sterile alpha motif domain containing 11 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000437963 // ENSEMBL // sterile alpha motif domain containing 11 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000455979 // ENSEMBL // sterile alpha motif domain containing 11 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000464948 // ENSEMBL // sterile alpha motif domain containing 11 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000466827 // ENSEMBL // sterile alpha motif domain containing 11 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000474461 // ENSEMBL // sterile alpha motif domain containing 11 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000478729 // ENSEMBL // sterile alpha motif domain containing 11 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000616016 // ENSEMBL // sterile alpha motif domain containing 11 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000616125 // ENSEMBL // sterile alpha motif domain containing 11 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000617307 // ENSEMBL // sterile alpha motif domain containing 11 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000618181 // ENSEMBL // sterile alpha motif domain containing 11 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000618323 // ENSEMBL // sterile alpha motif domain containing 11 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000618779 // ENSEMBL // sterile alpha motif domain containing 11 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000620200 // ENSEMBL // sterile alpha motif domain containing 11 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000622503 // ENSEMBL // sterile alpha motif domain containing 11 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC024295 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:39333 IMAGE:3354502), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033213 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:45873 IMAGE:5014368), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097860 // Havana transcript // sterile alpha motif domain containing 11[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097862 // Havana transcript // sterile alpha motif domain containing 11[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097863 // Havana transcript // sterile alpha motif domain containing 11[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097865 // Havana transcript // sterile alpha motif domain containing 11[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097866 // Havana transcript // sterile alpha motif domain containing 11[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097867 // Havana transcript // sterile alpha motif domain containing 11[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097868 // Havana transcript // sterile alpha motif domain containing 11[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000276866 // Havana transcript // sterile alpha motif domain containing 11[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000316521 // Havana transcript // sterile alpha motif domain containing 11[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS2.2 // ccdsGene // sterile alpha motif domain containing 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28706] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009185 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVERLAPTX, OVEXON best transcript NM_152486 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009186 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVERLAPTX, OVEXON best transcript NM_152486 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009187 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_152486 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009188 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_152486 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009189 // circbase // Salzman2013 ALT_DONOR, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_152486 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009190 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_152486 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009191 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_152486 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009192 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVERLAPTX, OVEXON best transcript NM_152486 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009193 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVERLAPTX, OVEXON best transcript NM_152486 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009194 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, OVCODE, OVERLAPTX, OVEXON, UTR3 best transcript NM_152486 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009195 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVERLAPTX, OVEXON best transcript NM_152486 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001abw.2 // UCSC Genes // sterile alpha motif domain containing 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28706] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc031pjt.2 // UCSC Genes // sterile alpha motif domain containing 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28706] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc031pju.2 // UCSC Genes // sterile alpha motif domain containing 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28706] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc031pkg.2 // UCSC Genes // sterile alpha motif domain containing 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28706] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc031pkh.2 // UCSC Genes // sterile alpha motif domain containing 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28706] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc031pkk.2 // UCSC Genes // sterile alpha motif domain containing 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28706] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc031pkm.2 // UCSC Genes // sterile alpha motif domain containing 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28706] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc031pko.2 // UCSC Genes // sterile alpha motif domain containing 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28706] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057axs.1 // UCSC Genes // sterile alpha motif domain containing 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28706] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057axt.1 // UCSC Genes // sterile alpha motif domain containing 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28706] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057axu.1 // UCSC Genes // sterile alpha motif domain containing 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28706] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057axv.1 // UCSC Genes // sterile alpha motif domain containing 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28706] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057axw.1 // UCSC Genes // sterile alpha motif domain containing 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28706] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057axx.1 // UCSC Genes // sterile alpha motif domain containing 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28706] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057axy.1 // UCSC Genes // sterile alpha motif domain containing 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28706] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057axz.1 // UCSC Genes // sterile alpha motif domain containing 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28706] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057aya.1 // UCSC Genes // sterile alpha motif domain containing 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28706] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000212 // lncRNAWiki // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000213 // lncRNAWiki // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
TC0100006479.hg.1
TC0100006479.hg.1
chr1
+
960587
965719
10
main
Multiple_Complex
NM_198317 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 17 (KLHL17), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000338591 // ENSEMBL // kelch-like family member 17 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000463212 // ENSEMBL // kelch-like family member 17 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000466300 // ENSEMBL // kelch-like family member 17 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000481067 // ENSEMBL // kelch-like family member 17 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000622660 // ENSEMBL // kelch-like family member 17 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097875 // Havana transcript // kelch-like 17 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097877 // Havana transcript // kelch-like 17 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097878 // Havana transcript // kelch-like 17 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097931 // Havana transcript // kelch-like 17 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC166618 // GenBank // Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100066344, MGC:195481 kelch-like 17 (Drosophila) (KLHL17) mRNA, encodes complete protein. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS30550.1 // ccdsGene // kelch-like family member 17 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:24023] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009209 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198317 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aca.3 // UCSC Genes // kelch-like family member 17 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:24023] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001acb.2 // UCSC Genes // kelch-like family member 17 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:24023] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057ayg.1 // UCSC Genes // kelch-like family member 17 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:24023] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057ayh.1 // UCSC Genes // kelch-like family member 17 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:24023] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057ayi.1 // UCSC Genes // kelch-like family member 17 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:24023] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057ayj.1 // UCSC Genes // N/A // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000617073 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:GRCh38:1:965110:965166:1 gene:ENSG00000277294 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000216 // lncRNAWiki // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
TC0100006480.hg.1
TC0100006480.hg.1
chr1
+
966497
975865
10
main
Multiple_Complex
NM_001160184 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family N member 1 (PLEKHN1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_032129 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family N member 1 (PLEKHN1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379407 // ENSEMBL // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379409 // ENSEMBL // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379410 // ENSEMBL // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000480267 // ENSEMBL // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000491024 // ENSEMBL // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101386 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family N member 1, mRNA (cDNA clone MGC:120613 IMAGE:40026400), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC101387 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family N member 1, mRNA (cDNA clone MGC:120616 IMAGE:40026404), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097940 // Havana transcript // pleckstrin homology domain containing, family N member 1[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097941 // Havana transcript // pleckstrin homology domain containing, family N member 1[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097942 // Havana transcript // pleckstrin homology domain containing, family N member 1[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000473255 // Havana transcript // pleckstrin homology domain containing, family N member 1[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000473256 // Havana transcript // pleckstrin homology domain containing, family N member 1[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS4.1 // ccdsGene // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:25284] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS53256.1 // ccdsGene // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:25284] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// PLEKHN1.aAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 84069 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// PLEKHN1.bAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 84069, RefSeq ID(s) NM_032129 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001acd.4 // UCSC Genes // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:25284] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ace.4 // UCSC Genes // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:25284] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001acf.4 // UCSC Genes // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:25284] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057ayk.1 // UCSC Genes // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:25284] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057ayl.1 // UCSC Genes // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:25284] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000217 // lncRNAWiki // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
TC0100006483.hg.1
TC0100006483.hg.1
chr1
+
1001138
1014541
10
main
Multiple_Complex
NM_005101 // RefSeq // Homo sapiens ISG15 ubiquitin-like modifier (ISG15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379389 // ENSEMBL // ISG15 ubiquitin-like modifier [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000624652 // ENSEMBL // ISG15 ubiquitin-like modifier [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000624697 // ENSEMBL // ISG15 ubiquitin-like modifier [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC009507 // GenBank // Homo sapiens ISG15 ubiquitin-like modifier, mRNA (cDNA clone MGC:3945 IMAGE:3545944), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097989 // Havana transcript // ISG15 ubiquitin-like modifier[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000479384 // Havana transcript // ISG15 ubiquitin-like modifier[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000479385 // Havana transcript // ISG15 ubiquitin-like modifier[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS6.1 // ccdsGene // ISG15 ubiquitin-like modifier [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:4053] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009211 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, OVCODE, OVEXON, UTR3 best transcript NM_005101 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ISG15.bAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 9636 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ISG15.cAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 9636 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001acj.5 // UCSC Genes // ISG15 ubiquitin-like modifier [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:4053] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057ayq.1 // UCSC Genes // ISG15 ubiquitin-like modifier [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:4053] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057ayr.1 // UCSC Genes // ISG15 ubiquitin-like modifier [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:4053] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
TC0100006486.hg.1
TC0100006486.hg.1
chr1
+
1020123
1056119
10
main
Multiple_Complex
NM_001305275 // RefSeq // Homo sapiens agrin (AGRN), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_198576 // RefSeq // Homo sapiens agrin (AGRN), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379370 // ENSEMBL // agrin [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000419249 // ENSEMBL // agrin [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000461111 // ENSEMBL // agrin [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000466223 // ENSEMBL // agrin [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000469403 // ENSEMBL // agrin [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477585 // ENSEMBL // agrin [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000478677 // ENSEMBL // agrin [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000479707 // ENSEMBL // agrin [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000492947 // ENSEMBL // agrin [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000620552 // ENSEMBL // agrin [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097990 // Havana transcript // agrin[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097991 // Havana transcript // agrin[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097992 // Havana transcript // agrin[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097993 // Havana transcript // agrin[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097994 // Havana transcript // agrin[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097995 // Havana transcript // agrin[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097996 // Havana transcript // agrin[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097997 // Havana transcript // agrin[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099680 // Havana transcript // agrin[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AGRN.mAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 375790 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// AGRN.nAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 375790 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS30551.1 // ccdsGene // agrin [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:329] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000418300.1 // lncRNAWiki // N/A // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009212 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, OVCODE, OVEXON, UTR5 best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009213 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009214 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009215 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009216 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009217 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009218 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009219 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009220 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009221 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009222 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009223 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009224 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009225 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009226 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009227 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009228 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009229 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009230 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009231 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009232 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009233 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009234 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009235 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009236 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009237 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009238 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_198576 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000097999 // Havana transcript // novel transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ack.3 // UCSC Genes // agrin [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:329] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057ayt.1 // UCSC Genes // agrin [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:329] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057ayu.1 // UCSC Genes // agrin [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:329] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057ayv.1 // UCSC Genes // agrin [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:329] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057ayw.1 // UCSC Genes // agrin [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:329] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057ayx.1 // UCSC Genes // agrin [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:329] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057ayy.1 // UCSC Genes // agrin [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:329] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057ayz.1 // UCSC Genes // agrin [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:329] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057aza.1 // UCSC Genes // agrin [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:329] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057azb.1 // UCSC Genes // agrin [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:329] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057azc.1 // UCSC Genes // N/A // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000418300 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1055033:1056116:1 gene:ENSG00000242590 gene_biotype:sense_intronic transcript_biotype:sense_intronic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// HG491578.1:1..402:ncRNA // RNACentral // long non-coding RNA OTTHUMT00000097999.1 (RP11-54O7.14 gene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000223 // lncRNAWiki // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000226 // lncRNAWiki // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
TC0100006490.hg.1
TC0100006490.hg.1
chr1
+
1137017
1144056
10
main
NonCoding
NR_038869 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1342 (LINC01342), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000416774 // ENSEMBL // long intergenic non-protein coding RNA 1342 [gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000416774.1 // lncRNAWiki // long intergenic non-protein coding RNA 1342 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:50551] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000002221 // Havana transcript // novel transcript // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001acv.4 // UCSC Genes // long intergenic non-protein coding RNA 1342 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:50551] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// HG491580.1:1..1620:ncRNA // RNACentral // long non-coding RNA OTTHUMT00000002221.1 (RP11-465B22.5 gene // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000249 // lncRNAWiki // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
TC0100006492.hg.1
TC0100006492.hg.1
chr1
+
1173884
1197935
10
main
Multiple_Complex
NM_001130045 // RefSeq // Homo sapiens tubulin tyrosine ligase-like family member 10 (TTLL10), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_153254 // RefSeq // Homo sapiens tubulin tyrosine ligase-like family member 10 (TTLL10), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379288 // ENSEMBL // tubulin tyrosine ligase-like family member 10 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379289 // ENSEMBL // tubulin tyrosine ligase-like family member 10 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379290 // ENSEMBL // tubulin tyrosine ligase-like family member 10 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000460998 // ENSEMBL // tubulin tyrosine ligase-like family member 10 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000486379 // ENSEMBL // tubulin tyrosine ligase-like family member 10 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000506177 // ENSEMBL // tubulin tyrosine ligase-like family member 10 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000514695 // ENSEMBL // tubulin tyrosine ligase-like family member 10 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126152 // GenBank // Homo sapiens tubulin tyrosine ligase-like family, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:161430 IMAGE:8991868), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC126154 // GenBank // Homo sapiens tubulin tyrosine ligase-like family, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:161432 IMAGE:8991870), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000002420 // Havana transcript // tubulin tyrosine ligase-like family, member 10[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000002421 // Havana transcript // tubulin tyrosine ligase-like family, member 10[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000002422 // Havana transcript // tubulin tyrosine ligase-like family, member 10[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000002423 // Havana transcript // tubulin tyrosine ligase-like family, member 10[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000367063 // Havana transcript // tubulin tyrosine ligase-like family, member 10[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000367064 // Havana transcript // tubulin tyrosine ligase-like family, member 10[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001acy.2 // UCSC Genes // Homo sapiens tubulin tyrosine ligase-like family, member 10 (TTLL10), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS44036.1 // ccdsGene // tubulin tyrosine ligase-like family member 10 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:26693] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS8.1 // ccdsGene // tubulin tyrosine ligase-like family member 10 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:26693] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TTLL10.aAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 254173, RefSeq ID(s) NM_001130045 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TTLL10.hAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 254173 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TTLL10.jAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 254173 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001acz.3 // UCSC Genes // tubulin tyrosine ligase-like family member 10 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:26693] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nyg.2 // UCSC Genes // tubulin tyrosine ligase-like family member 10 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:26693] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057azv.1 // UCSC Genes // tubulin tyrosine ligase-like family member 10 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:26693] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057azw.1 // UCSC Genes // tubulin tyrosine ligase-like family member 10 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:26693] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057azx.1 // UCSC Genes // tubulin tyrosine ligase-like family member 10 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:26693] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057azy.1 // UCSC Genes // tubulin tyrosine ligase-like family member 10 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:26693] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000258 // lncRNAWiki // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000259 // lncRNAWiki // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
TC0100006494.hg.1
TC0100006494.hg.1
chr1
+
1232249
1235041
10
main
Coding
NM_080605 // RefSeq // Homo sapiens UDP-Gal:betaGal beta 1,3-galactosyltransferase polypeptide 6 (B3GALT6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379198 // ENSEMBL // UDP-Gal:betaGal beta 1,3-galactosyltransferase polypeptide 6 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005071 // Havana transcript // UDP-Gal:betaGal beta 1,3-galactosyltransferase polypeptide 6[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC160034 // GenBank // Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100063970, MGC:193149 UDP-Gal:betaGal beta 1,3-galactosyltransferase polypeptide 6 (B3GALT6) mRNA, encodes complete protein. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS13.1 // ccdsGene // UDP-Gal:betaGal beta 1,3-galactosyltransferase polypeptide 6 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:17978] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001adk.4 // UCSC Genes // UDP-Gal:betaGal beta 1,3-galactosyltransferase polypeptide 6 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:17978] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
TC0100006497.hg.1
TC0100006497.hg.1
chr1
+
1280436
1292029
10
main
Multiple_Complex
NM_001130413 // RefSeq // Homo sapiens sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit (SCNN1D), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_037668 // RefSeq // Homo sapiens sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit (SCNN1D), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000325425 // ENSEMBL // sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000338555 // ENSEMBL // sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379099 // ENSEMBL // sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379101 // ENSEMBL // sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379116 // ENSEMBL // sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000400928 // ENSEMBL // sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000467651 // ENSEMBL // sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000470022 // ENSEMBL // sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000616713 // ENSEMBL // sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC125074 // GenBank // Homo sapiens sodium channel, nonvoltage-gated 1, delta, mRNA (cDNA clone MGC:149710 IMAGE:40117641), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC125075 // GenBank // Homo sapiens sodium channel, nonvoltage-gated 1, delta, mRNA (cDNA clone MGC:149711 IMAGE:40117643), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005800 // Havana transcript // sodium channel, nonvoltage-gated 1, delta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005801 // Havana transcript // sodium channel, nonvoltage-gated 1, delta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005802 // Havana transcript // sodium channel, nonvoltage-gated 1, delta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000005804 // Havana transcript // sodium channel, nonvoltage-gated 1, delta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352308 // Havana transcript // sodium channel, nonvoltage-gated 1, delta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000352309 // Havana transcript // sodium channel, nonvoltage-gated 1, delta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000407296 // Havana transcript // sodium channel, nonvoltage-gated 1, delta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS44037.2 // ccdsGene // sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:10601] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// SCNN1D.eAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 6339 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001adt.2 // UCSC Genes // sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:10601] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001adw.3 // UCSC Genes // sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:10601] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bbb.1 // UCSC Genes // sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:10601] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bbc.1 // UCSC Genes // sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:10601] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bbd.1 // UCSC Genes // sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:10601] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bbe.1 // UCSC Genes // sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:10601] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bbf.1 // UCSC Genes // sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:10601] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bbg.1 // UCSC Genes // sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:10601] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bbh.1 // UCSC Genes // sodium channel, non voltage gated 1 delta subunit [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:10601] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000272 // lncRNAWiki // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
TC0100006499.hg.1
TC0100006499.hg.1
chr1
+
1308567
1311677
10
main
Multiple_Complex
NM_153339 // RefSeq // Homo sapiens pseudouridylate synthase-like 1 (PUSL1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000379031 // ENSEMBL // pseudouridylate synthase-like 1 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000463758 // ENSEMBL // pseudouridylate synthase-like 1 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000467712 // ENSEMBL // pseudouridylate synthase-like 1 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000470520 // ENSEMBL // pseudouridylate synthase-like 1 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000493657 // ENSEMBL // pseudouridylate synthase-like 1 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC034304 // GenBank // Homo sapiens pseudouridylate synthase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:30098 IMAGE:4778177), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000009438 // Havana transcript // pseudouridylate synthase-like 1[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000009439 // Havana transcript // pseudouridylate synthase-like 1[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000009440 // Havana transcript // pseudouridylate synthase-like 1[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000009441 // Havana transcript // pseudouridylate synthase-like 1[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000009442 // Havana transcript // pseudouridylate synthase-like 1[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS20.1 // ccdsGene // pseudouridylate synthase-like 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:26914] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009258 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVERLAPTX, OVEXON best transcript NM_153339 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aed.4 // UCSC Genes // pseudouridylate synthase-like 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:26914] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bbt.1 // UCSC Genes // pseudouridylate synthase-like 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:26914] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bbu.1 // UCSC Genes // pseudouridylate synthase-like 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:26914] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bbv.1 // UCSC Genes // pseudouridylate synthase-like 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:26914] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bbw.1 // UCSC Genes // pseudouridylate synthase-like 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:26914] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000277 // lncRNAWiki // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Antisense,Exonic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
TC0100006501.hg.1
TC0100006501.hg.1
chr1
+
1324756
1328897
10
main
Multiple_Complex
NM_001029885 // RefSeq // Homo sapiens ceramide-1-phosphate transfer protein (CPTP), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000343938 // ENSEMBL // ceramide-1-phosphate transfer protein [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000464957 // ENSEMBL // ceramide-1-phosphate transfer protein [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000488011 // ENSEMBL // ceramide-1-phosphate transfer protein [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008742 // Havana transcript // ceramide-1-phosphate transfer protein[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008743 // Havana transcript // ceramide-1-phosphate transfer protein[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008744 // Havana transcript // ceramide-1-phosphate transfer protein[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS30555.1 // ccdsGene // ceramide-1-phosphate transfer protein [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28116] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009264 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, OVCODE, OVERLAPTX, OVEXON, UTR3, UTR5 best transcript NM_001029885 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aeo.4 // UCSC Genes // ceramide-1-phosphate transfer protein [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28116] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bdo.1 // UCSC Genes // ceramide-1-phosphate transfer protein [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28116] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bdp.1 // UCSC Genes // ceramide-1-phosphate transfer protein [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28116] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
TC0100006502.hg.1
TC0100006502.hg.1
chr1
+
1331314
1335306
10
main
Coding
NM_152228 // RefSeq // Homo sapiens taste receptor, type 1, member 3 (TAS1R3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000339381 // ENSEMBL // taste receptor, type 1, member 3 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008493 // Havana transcript // taste receptor, type 1, member 3[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS30556.1 // ccdsGene // taste receptor, type 1, member 3 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:15661] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nyk.3 // UCSC Genes // taste receptor, type 1, member 3 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:15661] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
TC0100006514.hg.1
TC0100006514.hg.1
chr1
+
1426128
1427787
10
main
Multiple_Complex
NM_001146685 // RefSeq // Homo sapiens transmembrane protein 88B (TMEM88B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378821 // ENSEMBL // transmembrane protein 88B [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000331012 // Havana transcript // transmembrane protein 88B[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nyp.2 // UCSC Genes // Homo sapiens transmembrane protein 88B (TMEM88B), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS57964.1 // ccdsGene // transmembrane protein 88B [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:37099] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// TMEM88B.aAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 643965, RefSeq ID(s) NM_001146685 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// lnc-VWA1-1:1 // lncRNAWiki // Transcript Originally Identified by LNCipedia // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
TC0100006516.hg.1
TC0100006516.hg.1
chr1
+
1434861
1442882
10
main
Coding
NM_022834 // RefSeq // Homo sapiens von Willebrand factor A domain containing 1 (VWA1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_199121 // RefSeq // Homo sapiens von Willebrand factor A domain containing 1 (VWA1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000338660 // ENSEMBL // von Willebrand factor A domain containing 1 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000471398 // ENSEMBL // von Willebrand factor A domain containing 1 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000476993 // ENSEMBL // von Willebrand factor A domain containing 1 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000495558 // ENSEMBL // von Willebrand factor A domain containing 1 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC059409 // GenBank // Homo sapiens von Willebrand factor A domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:71828 IMAGE:30349211), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008291 // Havana transcript // von Willebrand factor A domain containing 1[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008292 // Havana transcript // von Willebrand factor A domain containing 1[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008293 // Havana transcript // von Willebrand factor A domain containing 1[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000008294 // Havana transcript // von Willebrand factor A domain containing 1[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS27.1 // ccdsGene // von Willebrand factor A domain containing 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30910] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS28.2 // ccdsGene // von Willebrand factor A domain containing 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30910] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001afr.4 // UCSC Genes // von Willebrand factor A domain containing 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30910] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001afs.4 // UCSC Genes // von Willebrand factor A domain containing 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30910] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bfl.1 // UCSC Genes // von Willebrand factor A domain containing 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30910] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bfm.1 // UCSC Genes // von Willebrand factor A domain containing 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30910] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// VWA1.aAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 64856, RefSeq ID(s) NM_022834 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// VWA1.eAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 64856, RefSeq ID(s) NM_199121 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
TC0100006517.hg.1
TC0100006517.hg.1
chr1
+
1449689
1470158
10
main
Multiple_Complex
NM_001039211 // RefSeq // Homo sapiens ATPase family, AAA domain containing 3C (ATAD3C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378785 // ENSEMBL // ATPase family, AAA domain containing 3C [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000475091 // ENSEMBL // ATPase family, AAA domain containing 3C [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000484537 // ENSEMBL // ATPase family, AAA domain containing 3C [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000001279 // Havana transcript // ATPase family, AAA domain containing 3C[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000099686 // Havana transcript // ATPase family, AAA domain containing 3C[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000100304 // Havana transcript // ATPase family, AAA domain containing 3C[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aft.2 // UCSC Genes // Homo sapiens ATPase family, AAA domain containing 3C (ATAD3C), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ATAD3C.aAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 219293, RefSeq ID(s) NM_001039211 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ATAD3C.bAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 219293 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS44039.1 // ccdsGene // ATPase family, AAA domain containing 3C [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:32151] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009275 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, OVCODE, OVEXON, UTR3 best transcript NM_001039211 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bfn.1 // UCSC Genes // ATPase family, AAA domain containing 3C [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:32151] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bfo.1 // UCSC Genes // ATPase family, AAA domain containing 3C [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:32151] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
TC0100006524.hg.1
TC0100006524.hg.1
chr1
+
1615415
1630610
10
main
Multiple_Complex
NM_001170686 // RefSeq // Homo sapiens mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 (MIB2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001170687 // RefSeq // Homo sapiens mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 (MIB2), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001170688 // RefSeq // Homo sapiens mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 (MIB2), transcript variant 4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001170689 // RefSeq // Homo sapiens mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 (MIB2), transcript variant 5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_080875 // RefSeq // Homo sapiens mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 (MIB2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NR_033183 // RefSeq // Homo sapiens mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 (MIB2), transcript variant 6, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000355826 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378708 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378712 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000463492 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000464570 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000467597 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000470373 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000473511 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000477990 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000479659 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000483015 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000486072 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000487053 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000489635 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000502470 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000503789 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000504599 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000505370 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000505820 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000506488 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000507082 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000507229 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000508148 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000508455 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000510793 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000511502 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000511910 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000512004 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000514234 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000514363 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000518681 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000520777 // ENSEMBL // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC037542 // GenBank // Homo sapiens mindbomb homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:40472 IMAGE:5168033), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000158402 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000158403 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000158404 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000158405 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000158406 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000158407 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000158408 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000158409 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000158410 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000158411 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000158412 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000158413 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000158414 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000158415 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000158416 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365928 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365929 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365930 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365931 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365932 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365933 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365934 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365935 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365936 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365937 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365938 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365939 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365940 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365941 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365942 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365943 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000365944 // Havana transcript // mindbomb homolog 2 (Drosophila)[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS41224.2 // ccdsGene // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS53261.1 // ccdsGene // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS53262.1 // ccdsGene // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS53263.1 // ccdsGene // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS53264.1 // ccdsGene // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// MIB2.aAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 142678, RefSeq ID(s) NM_080875 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// MIB2.bAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 142678, RefSeq ID(s) NM_001170686 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// MIB2.cAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 142678, RefSeq ID(s) NM_001170687 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// MIB2.fAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 142678, RefSeq ID(s) NM_001170688 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// MIB2.gAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 142678 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// MIB2.jAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 142678, RefSeq ID(s) NR_033183 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// MIB2.lAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 142678 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// MIB2.viAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 142678 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001agg.4 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001agh.4 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001agi.4 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001agk.4 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001agm.4 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nyq.3 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgd.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bge.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgf.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgg.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgh.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgi.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgj.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgk.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgl.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgm.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgn.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgo.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgp.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgq.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgr.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgs.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgt.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgu.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgv.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgw.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgx.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgy.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bgz.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bha.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bhb.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bhc.1 // UCSC Genes // mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30577] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000344 // lncRNAWiki // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000345 // lncRNAWiki // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000346 // lncRNAWiki // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000347 // lncRNAWiki // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
TC0100006540.hg.1
TC0100006540.hg.1
chr1
+
1914827
1917296
10
main
Multiple_Complex
NM_138705 // RefSeq // Homo sapiens calmodulin-like 6 (CALML6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000307786 // ENSEMBL // calmodulin-like 6 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378604 // ENSEMBL // calmodulin-like 6 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000462293 // ENSEMBL // calmodulin-like 6 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000482402 // ENSEMBL // calmodulin-like 6 [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000002778 // Havana transcript // calmodulin-like 6[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000002779 // Havana transcript // calmodulin-like 6[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000002780 // Havana transcript // calmodulin-like 6[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000276929 // Havana transcript // calmodulin-like 6[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aih.1 // UCSC Genes // Homo sapiens calmodulin-like 6 (CALML6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC160060 // GenBank // Synthetic construct Homo sapiens clone IMAGE:100063996, MGC:193175 calmodulin-like 6 (CALML6) mRNA, encodes complete protein. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CALML6.bAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 163688 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS30566.1 // ccdsGene // calmodulin-like 6 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:24193] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bjo.1 // UCSC Genes // calmodulin-like 6 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:24193] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bjp.1 // UCSC Genes // calmodulin-like 6 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:24193] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bjq.1 // UCSC Genes // calmodulin-like 6 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:24193] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000374 // lncRNAWiki // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
TC0100006548.hg.1
TC0100006548.hg.1
chr1
+
2019324
2030753
10
main
Coding
NM_000815 // RefSeq // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, delta (GABRD), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378585 // ENSEMBL // gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, delta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC033801 // GenBank // Homo sapiens gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, delta, mRNA (cDNA clone MGC:45284 IMAGE:5171119), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098493 // Havana transcript // gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, delta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS36.1 // ccdsGene // gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, delta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:4084] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aip.3 // UCSC Genes // gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, delta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:4084] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
TC0100006550.hg.1
TC0100006550.hg.1
chr1
+
2050470
2185395
10
main
Multiple_Complex
NM_001033581 // RefSeq // Homo sapiens protein kinase C, zeta (PRKCZ), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001033582 // RefSeq // Homo sapiens protein kinase C, zeta (PRKCZ), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_001242874 // RefSeq // Homo sapiens protein kinase C, zeta (PRKCZ), transcript variant 4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NM_002744 // RefSeq // Homo sapiens protein kinase C, zeta (PRKCZ), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000378567 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000400920 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000400921 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000419838 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000461106 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000461465 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000466352 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000466651 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000468310 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000470511 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000470596 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000470986 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000471018 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000472017 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000478770 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000479263 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000479566 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000481140 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000482686 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000484419 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000486681 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000495347 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000496325 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000497183 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000503297 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000503672 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// ENST00000505322 // ENSEMBL // protein kinase C, zeta [gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC008058 // GenBank // Homo sapiens protein kinase C, zeta, mRNA (cDNA clone MGC:1669 IMAGE:2987996), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// BC014270 // GenBank // Homo sapiens protein kinase C, zeta, mRNA (cDNA clone MGC:10512 IMAGE:3835020), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003648 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003649 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003650 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003651 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000003653 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098531 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098532 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000098533 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000100280 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000100281 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000100282 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000317169 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000317170 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000317171 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000317172 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000317173 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000317174 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000317175 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000317176 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000317177 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000317178 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000317179 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000366156 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000366157 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000366186 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// OTTHUMT00000366187 // Havana transcript // protein kinase C, zeta[gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:processed_transcript] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001aiq.3 // UCSC Genes // Homo sapiens protein kinase C, zeta (PRKCZ), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS37.1 // ccdsGene // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS41229.1 // ccdsGene // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// CCDS55563.1 // ccdsGene // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009364 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, OVCODE, OVEXON, UTR5 best transcript NM_002744 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009365 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_002744 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009366 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_002744 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009367 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVEXON best transcript NM_002744 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// hsa_circ_0009368 // circbase // Salzman2013 ANNOTATED, CDS, coding, INTERNAL, OVCODE, OVERLAPTX, OVEXON best transcript NM_002744 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// PRKCZ.cAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 5590 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// PRKCZ.vbAug10 // Ace View // Transcript Identified by AceView, Entrez Gene ID(s) 5590 // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001air.4 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc001ais.4 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc009vlb.4 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc010nyw.3 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bkd.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bke.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bkf.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bkg.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bkh.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bki.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bkj.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bkk.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bkl.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bkm.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bkn.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bko.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bkp.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bkq.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bkr.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bks.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bkt.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bku.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bkw.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bkx.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bky.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// uc057bkz.1 // UCSC Genes // protein kinase C, zeta [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9412] // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000389 // lncRNAWiki // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000390 // lncRNAWiki // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000392 // lncRNAWiki // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0 /// NONHSAT000392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 100 // 0 // --- // 0
Total number of rows: 27189 Table truncated, full table size 114192 Kbytes .
Supplementary data files not provided